More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3550 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3550  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 355 aa  716    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.211522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  58.38 
 
 		 338 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  55.09 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  56.97 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  56.55 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  55.39 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  55.65 
 
 		 341 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  52.52 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  55.06 
 
 		 341 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  55.86 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  55.06 
 
 		 341 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  54.33 
 
 		 341 aa  378  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  52.69 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  54.49 
 
 		 338 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  53.73 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  52.38 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  59.2 
 
 		 335 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  53.71 
 
 		 339 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  52.02 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  53.13 
 
 		 338 aa  371  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  53.87 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  51.04 
 
 		 337 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  54.14 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  55.35 
 
 		 334 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 337 aa  371  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 338 aa  368  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  53.13 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  53.73 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  55.99 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  53.43 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  51.05 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  53.73 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 338 aa  368  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  50.45 
 
 		 338 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  52.99 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  52.99 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  52.08 
 
 		 337 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  52.69 
 
 		 337 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  51.05 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2147  UDP-glucose 4-epimerase  51.76 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  54.33 
 
 		 335 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  53.41 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  52.69 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  53.73 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  54.49 
 
 		 335 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  51.95 
 
 		 336 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  51.8 
 
 		 337 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  52.4 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  53.43 
 
 		 337 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2971  UDP-glucose 4-epimerase  55.22 
 
 		 336 aa  364  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.86287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 336 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 337 aa  364  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4008  UDP-glucose 4-epimerase  54.19 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000293012 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27450  UDP-galactose 4-epimerase  50.43 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2339  UDP-galactose 4-epimerase  52.79 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569597  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  54.76 
 
 		 345 aa  362  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  53.89 
 
 		 340 aa  362  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  49.25 
 
 		 342 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  52.23 
 
 		 366 aa  361  9e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  54.03 
 
 		 335 aa  360  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5166  UDP-glucose 4-epimerase  54.95 
 
 		 336 aa  361  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  53.59 
 
 		 340 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  52.24 
 
 		 373 aa  361  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  52.23 
 
 		 339 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  53.89 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  53.89 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  52.68 
 
 		 338 aa  359  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  52.4 
 
 		 336 aa  359  3e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  55.39 
 
 		 340 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  55.39 
 
 		 340 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  55.39 
 
 		 340 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  53.39 
 
 		 342 aa  358  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  53.59 
 
 		 340 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  55.69 
 
 		 340 aa  358  9e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1892  UDP-galactose 4-epimerase  51.61 
 
 		 377 aa  358  9e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  50.29 
 
 		 341 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2068  UDP-glucose 4-epimerase  55.09 
 
 		 340 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2195  UDP-glucose 4-epimerase  55.09 
 
 		 340 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0712  UDP-glucose 4-epimerase  55.09 
 
 		 340 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0994374  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  55.09 
 
 		 340 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  49.25 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  52.69 
 
 		 335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  52.52 
 
 		 339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  53.15 
 
 		 339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  52.23 
 
 		 339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  51.19 
 
 		 340 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  51.48 
 
 		 340 aa  356  2.9999999999999997e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  52.82 
 
 		 339 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  47.9 
 
 		 338 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  54.79 
 
 		 340 aa  354  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  47.6 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  47.6 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  50.72 
 
 		 353 aa  353  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  55.96 
 
 		 336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>