More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0534 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
321 aa  665    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0531  NAD-dependent epimerase; UDP-glucose 4-epimerase  92.83 
 
 
321 aa  622  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0749  hypothetical protein  93.15 
 
 
321 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.293192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0676  hypothetical protein  92.83 
 
 
321 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61639e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0658  hypothetical protein  93.15 
 
 
321 aa  623  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.186471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0689  hypothetical protein  92.52 
 
 
321 aa  620  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0531  NAD-dependent epimerase/dehydratase; L-threonine dehydrogenase  92.52 
 
 
321 aa  619  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4679  hypothetical protein  92.83 
 
 
321 aa  620  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.52987e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  91.28 
 
 
321 aa  614  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0621  hypothetical protein  93.27 
 
 
317 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2401  hypothetical protein  70.44 
 
 
378 aa  463  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.278357  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.08 
 
 
316 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0588  hypothetical protein  92.69 
 
 
224 aa  431  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.61 
 
 
321 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.947852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.61 
 
 
321 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.347386  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1235  epimerase/reductase, putative  62.54 
 
 
318 aa  412  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0194  UDP-glucose 4-epimerase, putative  63.06 
 
 
318 aa  412  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2958  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.51 
 
 
325 aa  402  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.55 
 
 
319 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.792015  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.09 
 
 
314 aa  348  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0196948 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.98 
 
 
315 aa  344  8.999999999999999e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04730  putative oxidoreductase protein  51.61 
 
 
348 aa  335  5.999999999999999e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.81 
 
 
312 aa  332  5e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.16 
 
 
315 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  50.32 
 
 
324 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000119526  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_003296  RS02291  putative oxidoreductase protein  49.84 
 
 
318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4802  L-threonine 3-dehydrogenase  49.52 
 
 
315 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4804  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.28 
 
 
333 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0311388  normal  0.870429 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.52 
 
 
331 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4846  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.52 
 
 
331 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.48 
 
 
322 aa  286  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.366766  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.34 
 
 
316 aa  276  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.92 
 
 
320 aa  239  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0587  NAD dependent epimerase/dehydratase, N-terminus  94.05 
 
 
91 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
357 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2014  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
332 aa  94.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0242724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1902  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.93 
 
 
332 aa  94.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000745281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2246  hypothetical protein  25.93 
 
 
332 aa  93.6  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000358577  normal  0.308003 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
326 aa  92.4  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2168  hypothetical protein  26.75 
 
 
326 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
323 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.784653  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321153  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
322 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
323 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
323 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173565  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67812  normal  0.377039 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.272869 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58049  normal  0.22893 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3730  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.38 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
335 aa  77  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal  0.0682728 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.317394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5621  nucleotide sugar epimerase  27.5 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259916  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
311 aa  75.9  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1422  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.63 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0581323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.19 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0592  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  28.74 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
335 aa  72.4  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0972  hypothetical protein  26.64 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2662  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  26.97 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.3 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.55139  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2553  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  21.2 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020426  hitchhiker  0.00495986 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.29 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.05 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5586  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0895  hypothetical protein  26.06 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4686  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.97 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>