More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2401 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2401  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  770    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.278357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0658  hypothetical protein  71.38 
 
 
321 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.186471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0676  hypothetical protein  71.07 
 
 
321 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61639e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0689  hypothetical protein  71.07 
 
 
321 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0531  NAD-dependent epimerase/dehydratase; L-threonine dehydrogenase  71.07 
 
 
321 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0531  NAD-dependent epimerase; UDP-glucose 4-epimerase  71.07 
 
 
321 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4679  hypothetical protein  71.07 
 
 
321 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.52987e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.75 
 
 
321 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0749  hypothetical protein  71.07 
 
 
321 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.293192  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0621  hypothetical protein  71.61 
 
 
317 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.44 
 
 
321 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.1 
 
 
316 aa  422  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.94 
 
 
319 aa  418  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.792015  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2958  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.62 
 
 
325 aa  419  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1235  epimerase/reductase, putative  63.41 
 
 
318 aa  417  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.83 
 
 
321 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.347386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.83 
 
 
321 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.947852  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.45 
 
 
315 aa  368  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0194  UDP-glucose 4-epimerase, putative  54.63 
 
 
318 aa  367  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0588  hypothetical protein  74.65 
 
 
224 aa  348  7e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.38 
 
 
314 aa  348  8e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0196948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.96 
 
 
315 aa  343  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.8 
 
 
312 aa  333  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04730  putative oxidoreductase protein  51.13 
 
 
348 aa  329  5.0000000000000004e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4804  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.51 
 
 
333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0311388  normal  0.870429 
 
 
-
 
NC_003296  RS02291  putative oxidoreductase protein  47.95 
 
 
318 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4846  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 
331 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 
331 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  45.14 
 
 
324 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000119526  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4802  L-threonine 3-dehydrogenase  46.37 
 
 
315 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.1 
 
 
322 aa  288  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.366766  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.91 
 
 
316 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.99 
 
 
320 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.92 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0587  NAD dependent epimerase/dehydratase, N-terminus  66.67 
 
 
91 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.784653  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2014  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.4 
 
 
332 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0242724  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
323 aa  93.6  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58049  normal  0.22893 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2246  hypothetical protein  23.4 
 
 
332 aa  93.2  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000358577  normal  0.308003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1902  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  23.1 
 
 
332 aa  92.8  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000745281  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
323 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321153  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173565  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
326 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2168  hypothetical protein  25.58 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
323 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0572  hypothetical protein  25.91 
 
 
323 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0444  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.91 
 
 
323 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
323 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67812  normal  0.377039 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1862  hypothetical protein  25.91 
 
 
323 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0895  hypothetical protein  25.91 
 
 
323 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2018  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  25.91 
 
 
323 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381925  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
322 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0972  hypothetical protein  25.83 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.25 
 
 
323 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.281448  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3730  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.12 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
323 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.64 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  24.62 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal  0.0682728 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  34.32 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.2 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000000196986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.34 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.272869 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2553  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.29 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020426  hitchhiker  0.00495986 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1637  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.115399  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13971  putative nucleotide sugar epimerase  28.51 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1471  nucleotide sugar epimerase  25.6 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
331 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.75 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5621  nucleotide sugar epimerase  27.46 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259916  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  31.36 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1422  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.19 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2598  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0016  hypothetical protein  24.14 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  28.11 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0025  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.05 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.730827  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.33 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0130  hypothetical protein  28.16 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>