More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1131 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
325 aa  630  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.317394 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.85 
 
 
327 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.85 
 
 
326 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.62 
 
 
327 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279609  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.38 
 
 
328 aa  408  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.54 
 
 
329 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60 
 
 
327 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.15 
 
 
325 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3557  putative UDP-glucose 4-epimerase  59.94 
 
 
327 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.44 
 
 
328 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal  0.0682728 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2100  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.82 
 
 
328 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.415706  decreased coverage  0.000106106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.51 
 
 
328 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.423023  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.85 
 
 
327 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0866778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.32 
 
 
328 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.611335  normal  0.301343 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.88 
 
 
330 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.272869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.66 
 
 
328 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.459249  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.73 
 
 
314 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0972  hypothetical protein  49.85 
 
 
323 aa  288  9e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.47 
 
 
323 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58049  normal  0.22893 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.24 
 
 
323 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.55 
 
 
323 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.784653  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.24 
 
 
323 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.24 
 
 
323 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173565  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.56 
 
 
323 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321153  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.26 
 
 
323 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67812  normal  0.377039 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.48 
 
 
329 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  48.16 
 
 
323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.281448  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0572  hypothetical protein  48.16 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0444  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  48.16 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2018  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  48.16 
 
 
323 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381925  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0895  hypothetical protein  47.85 
 
 
323 aa  281  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1862  hypothetical protein  47.85 
 
 
323 aa  281  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2168  hypothetical protein  47.85 
 
 
326 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3730  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.04 
 
 
327 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.72 
 
 
327 aa  278  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.34 
 
 
326 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2014  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.09 
 
 
332 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0242724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1902  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  45.4 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000745281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2246  hypothetical protein  44.79 
 
 
332 aa  269  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000358577  normal  0.308003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1422  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  52.48 
 
 
324 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.77 
 
 
326 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.53 
 
 
323 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1637  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.56 
 
 
326 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.115399  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.75 
 
 
319 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3035  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  44.76 
 
 
316 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3064  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  44.76 
 
 
316 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.516818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3119  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  44.34 
 
 
316 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0293341 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0145  hypothetical protein  45 
 
 
321 aa  251  9.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252079  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0130  hypothetical protein  45 
 
 
321 aa  251  9.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3223  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  44.44 
 
 
316 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3103  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  44.44 
 
 
316 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.06 
 
 
325 aa  245  9e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0016  hypothetical protein  39.25 
 
 
315 aa  245  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2553  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.24 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020426  hitchhiker  0.00495986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.71 
 
 
348 aa  232  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.238348  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00746  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14210)  41.82 
 
 
321 aa  226  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.761224  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.94 
 
 
342 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.765579  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
351 aa  219  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.33 
 
 
356 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.49188  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.99 
 
 
339 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal  0.87338 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03119  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12770)  38.12 
 
 
316 aa  218  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.49 
 
 
341 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08100  conserved hypothetical protein  39.7 
 
 
347 aa  206  4e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0451749  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.45 
 
 
339 aa  202  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000498566  decreased coverage  0.0000954183 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 
311 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.134819  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.95 
 
 
325 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00850  conserved expressed protein  36 
 
 
359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0904  hypothetical protein  34.55 
 
 
318 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344615  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2397  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.1 
 
 
306 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 
316 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3206  hypothetical protein  33.87 
 
 
328 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1940  hypothetical protein  34.84 
 
 
308 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35637  predicted protein  34.35 
 
 
635 aa  135  9e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5494  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.37 
 
 
306 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
320 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2958  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
325 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
319 aa  94.4  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.792015  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0689  hypothetical protein  29.55 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0658  hypothetical protein  29.25 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.186471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0531  NAD-dependent epimerase; UDP-glucose 4-epimerase  29.25 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0676  hypothetical protein  29.25 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61639e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0749  hypothetical protein  29.25 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.293192  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0531  NAD-dependent epimerase/dehydratase; L-threonine dehydrogenase  28.96 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0621  hypothetical protein  28.96 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4679  hypothetical protein  28.96 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.52987e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2401  hypothetical protein  27.56 
 
 
378 aa  77  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.278357  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.84 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1235  epimerase/reductase, putative  25.95 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  31.84 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4846  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  33.7 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>