More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3643 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 315 aa  655    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.95 
 
 		 314 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0196948 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.97 
 
 		 312 aa  392  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04730  putative oxidoreductase protein  56.83 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02291  putative oxidoreductase protein  53.8 
 
 		 318 aa  348  9e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.69 
 
 		 322 aa  347  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.366766  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  56.27 
 
 		 324 aa  346  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000119526  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4802  L-threonine 3-dehydrogenase  54.02 
 
 		 315 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2401  hypothetical protein  50.96 
 
 		 378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.278357  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4804  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.08 
 
 		 333 aa  342  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0311388  normal  0.870429 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0531  NAD-dependent epimerase/dehydratase; L-threonine dehydrogenase  51.44 
 
 		 321 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0531  NAD-dependent epimerase; UDP-glucose 4-epimerase  51.44 
 
 		 321 aa  339  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0676  hypothetical protein  51.44 
 
 		 321 aa  339  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61639e-17 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.66 
 
 		 331 aa  338  5e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0658  hypothetical protein  51.44 
 
 		 321 aa  338  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.186471  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4846  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.66 
 
 		 331 aa  338  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0689  hypothetical protein  51.44 
 
 		 321 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0621  hypothetical protein  51.44 
 
 		 317 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0749  hypothetical protein  51.44 
 
 		 321 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.293192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4679  hypothetical protein  51.44 
 
 		 321 aa  338  7e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.52987e-21 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2958  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.92 
 
 		 325 aa  337  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.8 
 
 		 321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.16 
 
 		 321 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.68 
 
 		 319 aa  326  4.0000000000000003e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.792015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.2 
 
 		 315 aa  315  6e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.33 
 
 		 316 aa  310  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.71 
 
 		 321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.347386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.71 
 
 		 321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.947852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.94 
 
 		 316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1235  epimerase/reductase, putative  44.59 
 
 		 318 aa  298  9e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0194  UDP-glucose 4-epimerase, putative  45.08 
 
 		 318 aa  288  9e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0588  hypothetical protein  51.82 
 
 		 224 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.06 
 
 		 320 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0587  NAD dependent epimerase/dehydratase, N-terminus  48.81 
 
 		 91 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0130  hypothetical protein  24.69 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0145  hypothetical protein  24.69 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2014  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0242724  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1902  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.51 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000745281  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2246  hypothetical protein  23.66 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000358577  normal  0.308003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  29.89 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2638  UDP-glucuronate 5'-epimerase  29.17 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0115301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.49 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2553  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.1 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020426  hitchhiker  0.00495986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1471  nucleotide sugar epimerase  26.23 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.134819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3730  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.12 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.77 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.1 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.1 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 		 249 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.68 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76750  UDP glucose-4-epimerase  31.36 
 
 		 688 aa  65.5  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.949645  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.22 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26933  normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.28 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2598  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.21 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal  0.0682728 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.39 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.39 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.23 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.51 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.38 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  25.45 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  30.81 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.03 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.1 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.13 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>