More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_76750 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_76750  UDP glucose-4-epimerase  100 
 
 		 688 aa  1421    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.949645  normal  0.956921 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04727  UDP-glucose 4-epimerase (Eurofung)  61.11 
 
 		 371 aa  440  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.497069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  58.48 
 
 		 340 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  58.77 
 
 		 340 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  58.45 
 
 		 340 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  58.19 
 
 		 340 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  55.98 
 
 		 339 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  58.48 
 
 		 340 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  58.19 
 
 		 340 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  58.48 
 
 		 340 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  57.6 
 
 		 340 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  57.6 
 
 		 340 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  54.97 
 
 		 336 aa  392  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  56.27 
 
 		 337 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  54.81 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  56.56 
 
 		 340 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  56.43 
 
 		 337 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  52.57 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  55.26 
 
 		 338 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  56.73 
 
 		 341 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  55.1 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  55.26 
 
 		 339 aa  382  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  53.67 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  55.1 
 
 		 334 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  57.6 
 
 		 340 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2195  UDP-glucose 4-epimerase  57.02 
 
 		 340 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382513  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2591  UDP-galactose 4-epimerase  52.34 
 
 		 337 aa  378  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  54.52 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  57.31 
 
 		 340 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  57.31 
 
 		 340 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  53.94 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0712  UDP-glucose 4-epimerase  57.02 
 
 		 340 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0994374  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2068  UDP-glucose 4-epimerase  57.02 
 
 		 340 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  57.31 
 
 		 340 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  53.94 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  54.65 
 
 		 341 aa  376  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  52.05 
 
 		 337 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  57.02 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  54.81 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  52.6 
 
 		 341 aa  375  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  54.52 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  54.49 
 
 		 339 aa  375  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  54.68 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  55.26 
 
 		 337 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  54.39 
 
 		 337 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  55.52 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  54.52 
 
 		 337 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  54.52 
 
 		 337 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  55.39 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  52.33 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  55.39 
 
 		 335 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  54.68 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  52.62 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  52.62 
 
 		 338 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  52.62 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  52.91 
 
 		 338 aa  372  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  52.77 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  51.45 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  53.06 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  52.62 
 
 		 338 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  54.39 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  52.63 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  55.1 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  53.33 
 
 		 339 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  54.39 
 
 		 337 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2810  UDP-galactose 4-epimerase  53.51 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0626054  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2147  UDP-glucose 4-epimerase  53.18 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  55.85 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  54.52 
 
 		 335 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  51.9 
 
 		 338 aa  369  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  51.88 
 
 		 343 aa  369  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  51.16 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  54.65 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  51.46 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  51.16 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  53.16 
 
 		 351 aa  367  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  51.6 
 
 		 336 aa  365  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  52.19 
 
 		 338 aa  365  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  52.19 
 
 		 338 aa  365  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  52.05 
 
 		 338 aa  365  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  52.34 
 
 		 338 aa  364  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  51.9 
 
 		 338 aa  363  4e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46785  UDP-glucose 4-epimerase  53.45 
 
 		 358 aa  363  6e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  53.22 
 
 		 339 aa  363  6e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2015  UDP-glucose 4-epimerase  51.31 
 
 		 339 aa  363  7.0000000000000005e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  51.31 
 
 		 342 aa  363  8e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  52.05 
 
 		 338 aa  362  9e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  50.58 
 
 		 338 aa  362  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  53.22 
 
 		 339 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  51.6 
 
 		 337 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  51.6 
 
 		 340 aa  362  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  52.19 
 
 		 340 aa  361  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  49.71 
 
 		 352 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  51.46 
 
 		 335 aa  360  6e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  50.58 
 
 		 338 aa  360  6e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  51.41 
 
 		 353 aa  359  9.999999999999999e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  51.74 
 
 		 336 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2339  UDP-galactose 4-epimerase  51.16 
 
 		 349 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569597  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2911  UDP-glucose 4-epimerase  51.02 
 
 		 342 aa  357  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27450  UDP-galactose 4-epimerase  51.26 
 
 		 355 aa  356  5.999999999999999e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>