More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0590 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
321 aa  671    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.347386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
321 aa  671    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.947852  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0194  UDP-glucose 4-epimerase, putative  80.25 
 
 
318 aa  541  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0531  NAD-dependent epimerase/dehydratase; L-threonine dehydrogenase  64.15 
 
 
321 aa  437  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.97 
 
 
321 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0689  hypothetical protein  63.84 
 
 
321 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0658  hypothetical protein  63.84 
 
 
321 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.186471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0531  NAD-dependent epimerase; UDP-glucose 4-epimerase  63.84 
 
 
321 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0749  hypothetical protein  64.15 
 
 
321 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.293192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0676  hypothetical protein  63.84 
 
 
321 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61639e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0621  hypothetical protein  64.22 
 
 
317 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4679  hypothetical protein  63.52 
 
 
321 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.52987e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.61 
 
 
321 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.55 
 
 
316 aa  401  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2401  hypothetical protein  57.83 
 
 
378 aa  395  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.278357  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1235  epimerase/reductase, putative  55.06 
 
 
318 aa  365  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2958  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.89 
 
 
325 aa  359  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.59 
 
 
319 aa  347  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.792015  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 
312 aa  316  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0588  hypothetical protein  66.67 
 
 
224 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04730  putative oxidoreductase protein  48.23 
 
 
348 aa  312  4.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.76 
 
 
314 aa  308  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0196948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.71 
 
 
315 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.67 
 
 
315 aa  293  3e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4804  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.14 
 
 
333 aa  285  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0311388  normal  0.870429 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.23 
 
 
331 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4846  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.23 
 
 
331 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4802  L-threonine 3-dehydrogenase  46.79 
 
 
315 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  42.01 
 
 
324 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000119526  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_003296  RS02291  putative oxidoreductase protein  46.28 
 
 
318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.28 
 
 
322 aa  272  6e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.366766  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.91 
 
 
316 aa  268  7e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 
320 aa  226  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0587  NAD dependent epimerase/dehydratase, N-terminus  57.65 
 
 
91 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
335 aa  86.7  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 
335 aa  86.3  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1902  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.03 
 
 
332 aa  86.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000745281  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2014  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0242724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2553  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.35 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020426  hitchhiker  0.00495986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2246  hypothetical protein  25.71 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000358577  normal  0.308003 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1471  nucleotide sugar epimerase  26.21 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
324 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.09 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0618  oligopeptide transporter OPT  26.58 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2168  hypothetical protein  25.25 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  27.54 
 
 
334 aa  77  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 
323 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.784653  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.53 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1862  hypothetical protein  27.15 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0895  hypothetical protein  27.15 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.74 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0592  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0572  hypothetical protein  26.82 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0444  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.82 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2640  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2018  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.82 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01321  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  26.48 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173565  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.58 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.281448  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.65 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0115301  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.59 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58049  normal  0.22893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.2 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.16 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.59 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.26 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5621  nucleotide sugar epimerase  27.66 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259916  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.92 
 
 
323 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321153  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  29.82 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3699  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
353 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.682682  normal  0.543496 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67812  normal  0.377039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>