More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1200 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 312 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04730  putative oxidoreductase protein  68.49 
 
 		 348 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.72 
 
 		 322 aa  448  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.366766  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.69 
 
 		 314 aa  418  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0196948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.97 
 
 		 315 aa  392  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02291  putative oxidoreductase protein  56.37 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4804  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.31 
 
 		 333 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0311388  normal  0.870429 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4802  L-threonine 3-dehydrogenase  56.96 
 
 		 315 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  55.13 
 
 		 324 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000119526  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.53 
 
 		 331 aa  351  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4846  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.53 
 
 		 331 aa  351  8e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2958  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 		 325 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0531  NAD-dependent epimerase/dehydratase; L-threonine dehydrogenase  50.81 
 
 		 321 aa  335  7e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0689  hypothetical protein  50.49 
 
 		 321 aa  333  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0531  NAD-dependent epimerase; UDP-glucose 4-epimerase  50.49 
 
 		 321 aa  333  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0658  hypothetical protein  50.49 
 
 		 321 aa  333  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.186471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0676  hypothetical protein  50.49 
 
 		 321 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61639e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0749  hypothetical protein  50.49 
 
 		 321 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.293192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4679  hypothetical protein  50.49 
 
 		 321 aa  332  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.52987e-21 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.84 
 
 		 316 aa  333  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2401  hypothetical protein  50.8 
 
 		 378 aa  332  4e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.278357  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0621  hypothetical protein  50.49 
 
 		 317 aa  332  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.81 
 
 		 321 aa  332  5e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0732  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.19 
 
 		 315 aa  331  1e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0341517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.16 
 
 		 321 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.55 
 
 		 319 aa  328  8e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.792015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 		 321 aa  316  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.947852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 		 321 aa  316  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.347386  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.54 
 
 		 316 aa  310  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0194  UDP-glucose 4-epimerase, putative  50 
 
 		 318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1235  epimerase/reductase, putative  48.06 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0588  hypothetical protein  50 
 
 		 224 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0587  NAD dependent epimerase/dehydratase, N-terminus  48.78 
 
 		 91 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3730  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.01 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2014  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.98 
 
 		 332 aa  79  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0242724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2246  hypothetical protein  22.98 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000358577  normal  0.308003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1902  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  22.18 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000745281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2553  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.94 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020426  hitchhiker  0.00495986 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58049  normal  0.22893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.43 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2168  hypothetical protein  22.67 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.784653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.78 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.281448  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.51 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0572  hypothetical protein  23.45 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0444  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.45 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1471  nucleotide sugar epimerase  25 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1862  hypothetical protein  23.45 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0895  hypothetical protein  23.45 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.1 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2018  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  23.45 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381925  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0016  hypothetical protein  23.6 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.83 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.63 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5621  nucleotide sugar epimerase  23.85 
 
 		 338 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259916  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.51 
 
 		 367 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  21.63 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.15 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.49188  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  27.33 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.1 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.73 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.1 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.84 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.07 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.39 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.27 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.5 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.01 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.63 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1637  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.115399  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1422  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.3 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144827  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.62 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.05 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.19 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.08 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1940  hypothetical protein  21.03 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.68 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2324  VI polysaccharide biosynthesis protein vipB/tviC  24.37 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3223  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.23 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  22.39 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3103  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.23 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.78 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.14 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>