More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1848 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
305 aa  626  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.377731  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1073  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 
345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.688029 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
501 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 
310 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.86 
 
 
310 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.51 
 
 
310 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
313 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 
312 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 
309 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
305 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.06 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 
316 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 
310 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 
309 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
315 aa  119  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 
309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  28.96 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
306 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
304 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
315 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  29.68 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0795  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.68 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
333 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.92 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1033  putative epimerase  32.16 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.48 
 
 
312 aa  114  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
317 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33900  UDP-glucose 4-epimerase  29.29 
 
 
313 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
312 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
310 aa  112  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
328 aa  112  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
295 aa  112  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000000196986 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
327 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
323 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
323 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11260  putative epimerase  32.31 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.07 
 
 
325 aa  109  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
309 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
309 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  30.03 
 
 
331 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
310 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 
306 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  28.8 
 
 
319 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
308 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
299 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
510 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  30.77 
 
 
338 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
310 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
313 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 
292 aa  106  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0671  UDP-glucose 4-epimerase  29.97 
 
 
327 aa  105  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
296 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  30.45 
 
 
327 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.62 
 
 
324 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
314 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0954433  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
308 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  30.63 
 
 
337 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
292 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
309 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 
310 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0958657  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
353 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
301 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
314 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
310 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.44 
 
 
307 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 
310 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
321 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
308 aa  103  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
321 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
331 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
311 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  29.45 
 
 
329 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
328 aa  102  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  28.81 
 
 
332 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
303 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
317 aa  102  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
319 aa  102  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  29.88 
 
 
308 aa  102  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
302 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
317 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  31.19 
 
 
328 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
324 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
292 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  30.28 
 
 
328 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  30.19 
 
 
333 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
324 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  29.45 
 
 
329 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  28.48 
 
 
328 aa  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.05 
 
 
388 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
299 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  27.6 
 
 
329 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>