More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1229 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 322 aa  664    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1073  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.78 
 
 		 345 aa  490  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.688029 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.04 
 
 		 332 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.377731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.66 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 		 333 aa  122  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 		 324 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690036  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.75 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6416  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955033  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5669  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869127 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.18 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1394  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  28.7 
 
 		 331 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 		 285 aa  99.4  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.48 
 
 		 343 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0337048 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 		 329 aa  96.3  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 		 321 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.46 
 
 		 501 aa  95.5  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0768033  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  28.16 
 
 		 329 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.4 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  28.4 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1669  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.82 
 
 		 357 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 		 312 aa  92.8  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 		 328 aa  92.4  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  34.14 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.61 
 
 		 310 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0958  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.384562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  23.84 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  25.67 
 
 		 360 aa  90.9  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2631  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.74 
 
 		 360 aa  90.5  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 510 aa  90.1  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  31.1 
 
 		 332 aa  90.1  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0710  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.44 
 
 		 337 aa  90.1  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  26.46 
 
 		 724 aa  90.1  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 		 312 aa  89  9e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  28.16 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  31.67 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.83 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.45 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  28.57 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  25.53 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  30.24 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  33.73 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  29.13 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  27.61 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  26.41 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  28.23 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  27.35 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.31 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  32.5 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  27.06 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  27.3 
 
 		 327 aa  86.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0795  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.04 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.38 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  30.87 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  28.04 
 
 		 345 aa  87  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  27.84 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>