More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1115 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
315 aa  635    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.05 
 
 
325 aa  435  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.62 
 
 
325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
321 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
328 aa  168  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.76 
 
 
501 aa  165  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  36.77 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 
353 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 
510 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.86 
 
 
346 aa  156  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.22 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.29 
 
 
724 aa  156  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.76 
 
 
346 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.6 
 
 
459 aa  153  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  37.28 
 
 
326 aa  153  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
348 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
350 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
342 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.76 
 
 
338 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 
342 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 
342 aa  142  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 
350 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 
328 aa  139  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.6 
 
 
336 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 
347 aa  136  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 
322 aa  135  9e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  29.38 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
342 aa  133  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.55 
 
 
347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.2 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2146  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.01 
 
 
308 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 
310 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.15 
 
 
309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
310 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
310 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
327 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 
330 aa  129  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.16 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.86 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
340 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
308 aa  126  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.83 
 
 
308 aa  125  6e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  29.21 
 
 
346 aa  125  9e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
321 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.21 
 
 
344 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  33.13 
 
 
345 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
321 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 
351 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
325 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  35.39 
 
 
298 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 
352 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
328 aa  122  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
342 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 
315 aa  120  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.87 
 
 
315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
312 aa  119  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
368 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 
313 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 
356 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
328 aa  116  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
292 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
312 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
316 aa  115  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  27.07 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
314 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.09 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 
306 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 
311 aa  112  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
312 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  27 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  26.43 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 
369 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437184  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1217  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.96 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.89 
 
 
312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
319 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.49 
 
 
312 aa  109  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
329 aa  109  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
333 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0169  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  34.66 
 
 
319 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
292 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
292 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
304 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.86 
 
 
342 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 
331 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.71 
 
 
323 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
310 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
306 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
313 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.6 
 
 
307 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>