More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0169 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0169  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  100 
 
 
319 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.29 
 
 
327 aa  491  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.7 
 
 
354 aa  394  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.873323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.74 
 
 
334 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.65 
 
 
332 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.75 
 
 
332 aa  332  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.299125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4100  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.58 
 
 
325 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 
325 aa  323  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.48 
 
 
326 aa  317  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1622  UDP-glucose 4-epimerase  49.68 
 
 
333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222296  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.39 
 
 
321 aa  259  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000491095  unclonable  4.61706e-23 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2064  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  41.51 
 
 
327 aa  256  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.72 
 
 
317 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.58 
 
 
321 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  41.58 
 
 
321 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  40.95 
 
 
321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.95 
 
 
321 aa  235  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  40.95 
 
 
321 aa  235  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.19 
 
 
321 aa  236  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.95 
 
 
321 aa  235  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.95 
 
 
321 aa  235  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  41.86 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.86 
 
 
321 aa  232  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  41.2 
 
 
321 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.94 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 
329 aa  212  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.463092  decreased coverage  0.00350753 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.29 
 
 
318 aa  209  7e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.39 
 
 
320 aa  206  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.01 
 
 
316 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.9 
 
 
316 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301245  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.87 
 
 
322 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.97 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150051  normal  0.64899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.5 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.809623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.73 
 
 
318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.67 
 
 
348 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115759  hitchhiker  0.00412284 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.12 
 
 
317 aa  200  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.9 
 
 
311 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132998  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 
317 aa  199  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 
341 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.66 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.91 
 
 
340 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.91 
 
 
340 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.26 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.44 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.257537 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.44 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.44 
 
 
313 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.99 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0857049  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1378  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.99 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280113  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2263  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.99 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171141  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.99 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.965327  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.99 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.47827  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1288  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.99 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.99 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0477125  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.78 
 
 
322 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.78 
 
 
311 aa  195  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6047  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.14 
 
 
348 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438767  normal  0.0540302 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.14 
 
 
348 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.14 
 
 
348 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.61 
 
 
330 aa  195  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.83 
 
 
314 aa  195  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3252  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  36.68 
 
 
314 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.07 
 
 
318 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.49 
 
 
311 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.67 
 
 
317 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  37.78 
 
 
340 aa  193  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
333 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  37.78 
 
 
340 aa  193  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 
321 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
333 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 
311 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.08 
 
 
315 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 
316 aa  193  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.8 
 
 
348 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.36 
 
 
313 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.186347 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.05 
 
 
318 aa  192  8e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.68 
 
 
313 aa  192  9e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
318 aa  192  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.26 
 
 
346 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 
311 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.366265  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3556  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.94 
 
 
321 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3245  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.12 
 
 
331 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.63 
 
 
320 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.579578  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.19 
 
 
315 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38 
 
 
337 aa  189  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38 
 
 
337 aa  189  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 
330 aa  189  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4391  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.31 
 
 
350 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626317  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.67 
 
 
345 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177339  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.66 
 
 
316 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.94 
 
 
315 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 
311 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.63 
 
 
324 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0900  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  36.88 
 
 
326 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.425817  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3393  dTDP-glucose 4,6-dehydratase, NAD-dependent epimerase/dehydratase-related protein  36.88 
 
 
326 aa  187  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.229105  normal  0.0838562 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.59 
 
 
345 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.381286  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.94 
 
 
347 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 
319 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.34 
 
 
333 aa  186  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.48 
 
 
319 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>