More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5395 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
327 aa  663    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0169  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  74.29 
 
 
319 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.67 
 
 
354 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.873323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.92 
 
 
334 aa  359  4e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.75 
 
 
332 aa  321  8e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4100  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.78 
 
 
325 aa  316  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.78 
 
 
325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.43 
 
 
332 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.299125 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.6 
 
 
326 aa  296  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1622  UDP-glucose 4-epimerase  48.73 
 
 
333 aa  287  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222296  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2064  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  43.12 
 
 
327 aa  257  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.95 
 
 
321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000491095  unclonable  4.61706e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.38 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.38 
 
 
321 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  38.68 
 
 
321 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.68 
 
 
321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.75 
 
 
321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.68 
 
 
321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.68 
 
 
321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  38.68 
 
 
321 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.06 
 
 
321 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.12 
 
 
321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.68 
 
 
321 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.22 
 
 
317 aa  205  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.94 
 
 
329 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.463092  decreased coverage  0.00350753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.03 
 
 
315 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 
317 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 
317 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 
336 aa  178  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150051  normal  0.64899 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  34.45 
 
 
340 aa  177  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  34.45 
 
 
340 aa  177  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2173  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.59 
 
 
332 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0967474  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.38 
 
 
330 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.14 
 
 
327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.809623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.22 
 
 
325 aa  172  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
318 aa  172  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
333 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
333 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.89 
 
 
318 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
314 aa  170  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 
313 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.186347 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
313 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.77 
 
 
337 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.1 
 
 
322 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 
330 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.77 
 
 
337 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 
348 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120111  normal  0.224068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301245  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2307  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124145  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3556  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.69 
 
 
321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 
318 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.16 
 
 
322 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 
318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 
345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.381286  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
330 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3245  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.49 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0230856  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.26 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.08 
 
 
345 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177339  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 
333 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
315 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.49 
 
 
319 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
309 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
311 aa  162  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132998  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 
343 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.76 
 
 
345 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.44 
 
 
340 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 
319 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  0.0304013 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 
333 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.44 
 
 
340 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
321 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
318 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.06 
 
 
346 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258351  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 
315 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380397  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.48 
 
 
329 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
341 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.94 
 
 
353 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
324 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
313 aa  160  4e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
311 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41531  nad-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
514 aa  159  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 
311 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
311 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.366265  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
312 aa  159  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
318 aa  159  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
322 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
310 aa  158  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.453654  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.81 
 
 
313 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1378  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.2 
 
 
348 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280113  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.26 
 
 
310 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>