More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4713 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
327 aa  662    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.809623 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.48 
 
 
329 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.463092  decreased coverage  0.00350753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2173  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.6 
 
 
332 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0967474  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.56 
 
 
321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000491095  unclonable  4.61706e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.31 
 
 
321 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.5 
 
 
321 aa  232  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.12 
 
 
321 aa  232  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  38.8 
 
 
321 aa  229  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.5 
 
 
321 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.8 
 
 
321 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.8 
 
 
321 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.8 
 
 
321 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  38.8 
 
 
321 aa  229  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.12 
 
 
321 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.17 
 
 
321 aa  223  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.95 
 
 
332 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0169  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  39.5 
 
 
319 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.24 
 
 
332 aa  210  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.299125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
334 aa  209  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.99 
 
 
354 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.873323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4100  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.11 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.59 
 
 
326 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.48 
 
 
325 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.14 
 
 
327 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.11 
 
 
312 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1622  UDP-glucose 4-epimerase  37.29 
 
 
333 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222296  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 
328 aa  175  9e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2064  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  35.96 
 
 
327 aa  172  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.94 
 
 
321 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 
314 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 
327 aa  169  9e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
317 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.31 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26091  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.94 
 
 
313 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal  0.136094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.49 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.8 
 
 
317 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.53 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14221  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.33 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.49 
 
 
316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.84 
 
 
328 aa  162  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 
307 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.35 
 
 
324 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.63 
 
 
328 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.09 
 
 
316 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.53 
 
 
322 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  35.22 
 
 
326 aa  156  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.09 
 
 
311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1255  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.92 
 
 
352 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253884  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1194  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.92 
 
 
352 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.192355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.93 
 
 
330 aa  155  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 
346 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258351  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 
322 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 
311 aa  155  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.69 
 
 
319 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
313 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 
318 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.91 
 
 
318 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 
343 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.41 
 
 
353 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.03 
 
 
319 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 
360 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26434  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 
330 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.746716  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 
313 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.8 
 
 
320 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.579578  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1505  dTDP-glucose 4-6-dehydratase  34.92 
 
 
331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 
337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0779716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.31 
 
 
308 aa  153  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3252  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.96 
 
 
314 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
313 aa  153  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.18 
 
 
348 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 
346 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.67 
 
 
315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.28 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0514  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  35.03 
 
 
337 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
318 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 
341 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 
309 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0189  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.38 
 
 
316 aa  152  8e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.496773  decreased coverage  0.00806939 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5669  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
307 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.86 
 
 
346 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218972  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 
318 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.18 
 
 
311 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 
319 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  0.0304013 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02560  UDP-glucuronic acid decarboxylase Uxs1p  35.29 
 
 
410 aa  150  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.17 
 
 
346 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.43 
 
 
321 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
313 aa  151  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
351 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.151939  normal  0.0166428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 
316 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.4 
 
 
318 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.85 
 
 
325 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.54 
 
 
348 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0857049  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1378  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.54 
 
 
348 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280113  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.54 
 
 
348 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.965327  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2263  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.54 
 
 
348 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171141  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.54 
 
 
348 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0477125  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.54 
 
 
348 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.47827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>