More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2116 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
329 aa  663    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.463092  decreased coverage  0.00350753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.48 
 
 
327 aa  360  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.809623 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2173  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.02 
 
 
332 aa  359  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0967474  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.38 
 
 
321 aa  252  7e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000491095  unclonable  4.61706e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.93 
 
 
321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  38.56 
 
 
321 aa  219  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.24 
 
 
321 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.24 
 
 
321 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.24 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  38.24 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.17 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.24 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.24 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0169  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  37.62 
 
 
319 aa  212  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.93 
 
 
321 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.93 
 
 
321 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4100  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.3 
 
 
325 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 
326 aa  206  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.8 
 
 
334 aa  205  9e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.44 
 
 
332 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.09 
 
 
332 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.299125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.39 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.86 
 
 
354 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.873323  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.94 
 
 
327 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.66 
 
 
321 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal  0.136094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1622  UDP-glucose 4-epimerase  37.75 
 
 
333 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.8 
 
 
312 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 
313 aa  171  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.92 
 
 
318 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 
317 aa  168  9e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
335 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 
313 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 
343 aa  168  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3252  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  35.91 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
323 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.09 
 
 
313 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.97 
 
 
365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561113  normal  0.0105388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.5 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 
314 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.78 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.14 
 
 
322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.93 
 
 
328 aa  162  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.85 
 
 
313 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.97 
 
 
346 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
307 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
336 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150051  normal  0.64899 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.46 
 
 
347 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.06 
 
 
318 aa  159  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 
318 aa  159  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14221  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.61 
 
 
311 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.54 
 
 
320 aa  158  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.14 
 
 
309 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41531  nad-dependent epimerase/dehydratase  32.71 
 
 
514 aa  157  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.14 
 
 
356 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 
342 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.76 
 
 
308 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02560  UDP-glucuronic acid decarboxylase Uxs1p  33.03 
 
 
410 aa  157  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.02 
 
 
327 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 
340 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.09 
 
 
313 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
322 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 
340 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  34.38 
 
 
326 aa  157  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
346 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 
309 aa  156  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.14 
 
 
346 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218972  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
316 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301245  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.96 
 
 
314 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0262  sugar nucleotide dehydratase  37.5 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129808  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 
308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2118  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 
336 aa  156  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292316  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.09 
 
 
313 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0261  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.51 
 
 
311 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.370218  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.46 
 
 
353 aa  156  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
334 aa  155  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
328 aa  155  9e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5669  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
307 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869127 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0514  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  35.6 
 
 
337 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26091  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.94 
 
 
313 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.31 
 
 
311 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 
317 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.58 
 
 
313 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.89 
 
 
348 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120111  normal  0.224068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 
337 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5321  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.19 
 
 
313 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.57 
 
 
318 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.8 
 
 
326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  36.34 
 
 
325 aa  153  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 
315 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  34.7 
 
 
340 aa  153  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  34.7 
 
 
340 aa  153  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1505  dTDP-glucose 4-6-dehydratase  34.56 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
311 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132998  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 
333 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 
333 aa  152  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>