More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2146 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2146  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
308 aa  628  1e-179  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1217  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.18 
 
 
308 aa  413  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.95 
 
 
318 aa  351  8e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.42 
 
 
307 aa  344  1e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.94 
 
 
307 aa  343  2e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.55 
 
 
330 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.63 
 
 
330 aa  335  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.29 
 
 
318 aa  335  5e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.3 
 
 
312 aa  334  1e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.32 
 
 
318 aa  333  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.57 
 
 
323 aa  332  4e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.74 
 
 
342 aa  330  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.26 
 
 
322 aa  329  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.94 
 
 
323 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.4 
 
 
344 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.49 
 
 
327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.61 
 
 
322 aa  326  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.61 
 
 
323 aa  326  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.61 
 
 
322 aa  325  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.29 
 
 
322 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.29 
 
 
322 aa  324  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.29 
 
 
322 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.72 
 
 
342 aa  323  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.3 
 
 
320 aa  323  3e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3079  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.72 
 
 
342 aa  322  6e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.544275  unclonable  0.000000030667 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.97 
 
 
322 aa  322  7e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.62 
 
 
334 aa  322  7e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.65 
 
 
330 aa  320  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0307  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.12 
 
 
339 aa  319  5e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5789  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.08 
 
 
331 aa  319  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0435819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.43 
 
 
331 aa  316  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.66 
 
 
357 aa  315  7e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1538  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.11 
 
 
336 aa  312  3.9999999999999997e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00186226  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.8 
 
 
330 aa  311  7.999999999999999e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.22 
 
 
362 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1124  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.97 
 
 
323 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0644506  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0415  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.31 
 
 
324 aa  308  8e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.021137  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.74 
 
 
341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.76 
 
 
341 aa  305  6e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4211  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.74 
 
 
331 aa  305  7e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6490  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.48 
 
 
325 aa  305  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.91 
 
 
352 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3431  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.46 
 
 
337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.29 
 
 
350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2222  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.44 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  51.1 
 
 
360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.24 
 
 
353 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.850535  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.64 
 
 
336 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0632  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.49 
 
 
340 aa  301  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
329 aa  301  9e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3100  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.56 
 
 
328 aa  301  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.226707  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4019  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.91 
 
 
352 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.76 
 
 
340 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.04 
 
 
351 aa  300  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.611799  normal  0.380858 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.16 
 
 
342 aa  300  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.948095  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8193  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
338 aa  299  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.24 
 
 
355 aa  299  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.27 
 
 
357 aa  298  6e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.67 
 
 
337 aa  298  7e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.18378  hitchhiker  0.0000000578516 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.84 
 
 
330 aa  298  9e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.58 
 
 
352 aa  296  2e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.6 
 
 
357 aa  296  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.58 
 
 
339 aa  296  3e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2363  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.8 
 
 
324 aa  296  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.35 
 
 
336 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.95 
 
 
340 aa  295  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.35 
 
 
336 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2139  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.93 
 
 
356 aa  295  8e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.23 
 
 
348 aa  295  8e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2246  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.45 
 
 
324 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.844731  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.03 
 
 
336 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.24 
 
 
353 aa  292  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.36 
 
 
336 aa  292  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.88 
 
 
356 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.724349  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.96 
 
 
340 aa  291  9e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.24 
 
 
356 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0878  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.17 
 
 
353 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1350  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.69 
 
 
363 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.505877  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3803  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.62 
 
 
350 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0773  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.85 
 
 
358 aa  289  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781884  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0761  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.24 
 
 
353 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4166  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.93 
 
 
361 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.167438  normal  0.0625555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.23 
 
 
358 aa  289  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.16 
 
 
354 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0628  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.16 
 
 
357 aa  289  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4022  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.01 
 
 
360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4335  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.62 
 
 
349 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1071  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.04 
 
 
348 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1669  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.56 
 
 
357 aa  288  6e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.46 
 
 
364 aa  288  6e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1850  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.96 
 
 
325 aa  288  7e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0128954  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0537  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.87 
 
 
353 aa  288  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.433038  normal  0.0400591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4331  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.73 
 
 
331 aa  288  7e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2379  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.16 
 
 
349 aa  288  8e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.577133  hitchhiker  0.00102073 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.95 
 
 
322 aa  288  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5507  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.32 
 
 
349 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.23 
 
 
358 aa  286  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.4 
 
 
323 aa  287  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3235  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.24 
 
 
352 aa  287  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.2 
 
 
354 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>