More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0512 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  97.63 
 
 
352 aa  682    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
339 aa  692    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  78.11 
 
 
348 aa  541  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1749  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.82 
 
 
354 aa  501  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.26 
 
 
351 aa  484  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.611799  normal  0.380858 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0482  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.75 
 
 
349 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0600  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.75 
 
 
349 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0365968  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.99 
 
 
356 aa  437  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.449381  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.16 
 
 
355 aa  428  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.610294  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.57 
 
 
362 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.17 
 
 
342 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.48 
 
 
352 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.72 
 
 
330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.04 
 
 
318 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.89 
 
 
337 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2401  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.69 
 
 
398 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.75 
 
 
329 aa  392  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.27 
 
 
358 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.34 
 
 
357 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.69 
 
 
356 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.46 
 
 
322 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.75 
 
 
358 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.9 
 
 
322 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.16 
 
 
322 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2291  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.41 
 
 
349 aa  381  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.494545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.9 
 
 
359 aa  381  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.18 
 
 
362 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0516  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.92 
 
 
349 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.12 
 
 
323 aa  381  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1889  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.92 
 
 
345 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0868281  hitchhiker  0.00930049 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.16 
 
 
322 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.08 
 
 
354 aa  381  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.87 
 
 
322 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.87 
 
 
322 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.96 
 
 
350 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.87 
 
 
322 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.16 
 
 
355 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.52 
 
 
323 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.09 
 
 
354 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1911  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.41 
 
 
355 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5840  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.43 
 
 
352 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.481427 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1778  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55 
 
 
349 aa  375  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00040311  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.55 
 
 
342 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1758  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.73 
 
 
355 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1995  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.12 
 
 
357 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.10362  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.9 
 
 
355 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 
362 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.793551  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1441  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.88 
 
 
362 aa  373  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.62 
 
 
336 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1723  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.53 
 
 
341 aa  374  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000370368  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1511  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.6 
 
 
351 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1797  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.5 
 
 
338 aa  374  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0354  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.76 
 
 
348 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3391  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.49 
 
 
354 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.478209  normal  0.0989265 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13118  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.65 
 
 
350 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.57 
 
 
357 aa  368  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.69 
 
 
336 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.76 
 
 
353 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.850535  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1785  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.58 
 
 
346 aa  368  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.08 
 
 
357 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.09 
 
 
351 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.35 
 
 
351 aa  364  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0602  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.14 
 
 
379 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.159192  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5900  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  53.06 
 
 
352 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.69 
 
 
336 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.6 
 
 
341 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.75 
 
 
355 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68170  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  53.06 
 
 
352 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0640014  decreased coverage  0.00283529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0441  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.14 
 
 
379 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3994  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.35 
 
 
355 aa  364  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.44 
 
 
355 aa  364  1e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.77 
 
 
356 aa  364  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.79 
 
 
337 aa  364  1e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.18378  hitchhiker  0.0000000578516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4022  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55 
 
 
360 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.8 
 
 
336 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0715  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.25 
 
 
353 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256455  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4166  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.96 
 
 
361 aa  363  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.167438  normal  0.0625555 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  57.89 
 
 
360 aa  363  2e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0253  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.13 
 
 
352 aa  363  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.430028  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0503  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.91 
 
 
351 aa  363  3e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0802438  normal  0.0327306 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0216  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.15 
 
 
330 aa  363  3e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.240285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.8 
 
 
356 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.724349  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1124  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.12 
 
 
323 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0644506  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.06 
 
 
354 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.82 
 
 
350 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3491  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.94 
 
 
354 aa  362  7.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.370229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0537  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.69 
 
 
353 aa  361  9e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.433038  normal  0.0400591 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2106  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.59 
 
 
350 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0474818  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.22 
 
 
367 aa  360  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1237  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.78 
 
 
354 aa  360  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0277  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.43 
 
 
352 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.65 
 
 
355 aa  359  4e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1785  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.71 
 
 
366 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.89 
 
 
341 aa  358  6e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1917  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.8 
 
 
354 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.20541 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0195  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.44 
 
 
353 aa  357  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.59 
 
 
360 aa  357  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.65 
 
 
355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0926  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.14 
 
 
366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770588  normal  0.575373 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0553  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.1 
 
 
355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>