More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0632 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0632  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
340 aa  691    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0415  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  66.46 
 
 
324 aa  435  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.021137  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.27 
 
 
330 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6490  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.62 
 
 
325 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4331  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.06 
 
 
331 aa  401  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.15 
 
 
330 aa  398  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4211  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.39 
 
 
331 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.19 
 
 
336 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.62 
 
 
357 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.5 
 
 
318 aa  366  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.56 
 
 
320 aa  358  6e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.23 
 
 
318 aa  354  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2222  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.58 
 
 
335 aa  354  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.77 
 
 
330 aa  345  5e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8193  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.96 
 
 
338 aa  345  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
323 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.23 
 
 
323 aa  323  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
322 aa  322  6e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.69 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.08 
 
 
342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.37 
 
 
322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.37 
 
 
322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.99 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.37 
 
 
322 aa  319  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.35 
 
 
342 aa  318  7e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.06 
 
 
322 aa  318  9e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.55 
 
 
340 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.37 
 
 
322 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.41 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.53 
 
 
340 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2246  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.86 
 
 
324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.844731  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2363  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.23 
 
 
324 aa  312  5.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5789  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.56 
 
 
331 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0435819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.37 
 
 
336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.46 
 
 
342 aa  308  8e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.22 
 
 
341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.32 
 
 
342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.948095  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
336 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.67 
 
 
352 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.6 
 
 
318 aa  305  6e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.31 
 
 
336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.71 
 
 
327 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.79 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2146  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.32 
 
 
308 aa  301  8.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.52 
 
 
307 aa  300  2e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.06 
 
 
336 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1124  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.92 
 
 
323 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0644506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.54 
 
 
307 aa  300  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.13 
 
 
329 aa  298  7e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.78 
 
 
355 aa  298  9e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.33 
 
 
362 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.09 
 
 
355 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0307  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.34 
 
 
339 aa  296  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.9 
 
 
362 aa  295  8e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.51 
 
 
312 aa  295  9e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.56 
 
 
357 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1217  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.69 
 
 
308 aa  293  3e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.72 
 
 
356 aa  292  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1618  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.99 
 
 
359 aa  292  6e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3079  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.13 
 
 
342 aa  292  7e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.544275  unclonable  0.000000030667 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.04 
 
 
341 aa  290  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.2 
 
 
340 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.14 
 
 
348 aa  290  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.85 
 
 
344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2139  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.55 
 
 
356 aa  288  8e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.61 
 
 
337 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.63 
 
 
323 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.45 
 
 
350 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0540  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.02 
 
 
363 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0878  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.04 
 
 
353 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.15 
 
 
355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.15 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3431  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.13 
 
 
337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3803  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.04 
 
 
350 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5836  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.91 
 
 
350 aa  285  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.31 
 
 
354 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.95 
 
 
359 aa  285  9e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.02 
 
 
331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2596  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.73 
 
 
353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0120  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.63 
 
 
353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.19 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.83 
 
 
353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0761  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.75 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0389  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.73 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0871  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.73 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.83298  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.54 
 
 
339 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  45.82 
 
 
360 aa  282  6.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3727  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.13 
 
 
353 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1714  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.13 
 
 
353 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.88 
 
 
358 aa  281  9e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0842  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.43 
 
 
353 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0136971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4335  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.2 
 
 
349 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5507  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.48 
 
 
349 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1469  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.15 
 
 
397 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.793194  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1669  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.57 
 
 
357 aa  280  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.94 
 
 
352 aa  280  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.55 
 
 
358 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.97 
 
 
357 aa  280  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0682  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  47.29 
 
 
354 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3100  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  41.96 
 
 
328 aa  280  3e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.226707  normal  0.106215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>