More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3680 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 341 aa  704    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  69.12 
 
 		 342 aa  511  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.85 
 
 		 337 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  69.62 
 
 		 360 aa  480  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.11 
 
 		 342 aa  431  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.88 
 
 		 330 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.89 
 
 		 362 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.47 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.41 
 
 		 318 aa  404  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1917  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.76 
 
 		 354 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.20541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1758  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.76 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.5 
 
 		 322 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.19 
 
 		 322 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.5 
 
 		 322 aa  401  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.63 
 
 		 323 aa  401  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.46 
 
 		 336 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.13 
 
 		 356 aa  398  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.449381  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.88 
 
 		 322 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.19 
 
 		 323 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.19 
 
 		 322 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.88 
 
 		 322 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.6 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.57 
 
 		 322 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.84 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.37 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0516  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.68 
 
 		 349 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.73 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.87 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.84 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1911  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.45 
 
 		 355 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1889  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.06 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0868281  hitchhiker  0.00930049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1511  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.43 
 
 		 351 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1995  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.10362  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1723  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.4 
 
 		 341 aa  388  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000370368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.29 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2291  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.69 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.494545  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13118  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.02 
 
 		 350 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399683  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.69 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0354  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.61 
 
 		 348 aa  388  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.23 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.3 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.74 
 
 		 355 aa  384  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.58 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.32 
 
 		 318 aa  385  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2895  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.13 
 
 		 351 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.97 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.6 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5840  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.34 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.481427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.32 
 
 		 318 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.68 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.85 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.610294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0180  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  53.89 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0243  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  53.89 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1350  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.14 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.505877  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1778  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.86 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00040311  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.7 
 
 		 329 aa  384  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.73 
 
 		 327 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.89 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.58 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3285  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.74 
 
 		 353 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.99 
 
 		 350 aa  378  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.94 
 
 		 320 aa  380  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.35 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3391  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.27 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.478209  normal  0.0989265 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.7 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1212  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.09 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  decreased coverage  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.35 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.99 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.24 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.611799  normal  0.380858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.27 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.94 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0307  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.92 
 
 		 339 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.77 
 
 		 341 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.16 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0482  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.48 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0600  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.48 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0365968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1124  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.19 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0644506  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03666  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.65 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4188  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.65 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.06 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2890  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  53.28 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4215  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.65 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03615  hypothetical protein  52.65 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.35 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1749  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.5 
 
 		 354 aa  373  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.69 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4299  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.65 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.65 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.65 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1318  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.98 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0342732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  52.54 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01947  dTDP-glucose 4,6 dehydratase, NAD(P)-binding  50.69 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1785  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.23 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1601  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.25 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.69 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1398  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  52.42 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4723  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.91 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234117 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.92 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>