More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1723 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1723  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
341 aa  706    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000370368  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1758  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  88.53 
 
 
355 aa  634    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1911  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  83.87 
 
 
355 aa  608  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1917  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  84.46 
 
 
354 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.20541 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1889  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  82.94 
 
 
345 aa  597  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0868281  hitchhiker  0.00930049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2291  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  81.82 
 
 
349 aa  593  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.494545  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1778  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  82.11 
 
 
349 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00040311  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0516  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  79.77 
 
 
349 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1995  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  79.18 
 
 
357 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.10362  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  77.29 
 
 
350 aa  558  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  76.61 
 
 
350 aa  543  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1511  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  73.18 
 
 
351 aa  528  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2895  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  74.12 
 
 
351 aa  525  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5840  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  72.67 
 
 
352 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.481427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3391  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.47 
 
 
354 aa  525  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.478209  normal  0.0989265 
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  72.43 
 
 
354 aa  520  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0354  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  72.27 
 
 
348 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13118  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.76 
 
 
350 aa  520  1e-146  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399683  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0216  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.79 
 
 
330 aa  471  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.240285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.12 
 
 
359 aa  418  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.71 
 
 
358 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60 
 
 
358 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.35 
 
 
357 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1350  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.77 
 
 
363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.505877  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.52 
 
 
355 aa  401  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.9 
 
 
362 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.65 
 
 
354 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0103955  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.27 
 
 
358 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.52 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.1 
 
 
355 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.26 
 
 
354 aa  396  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.18 
 
 
356 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.36 
 
 
357 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01947  dTDP-glucose 4,6 dehydratase, NAD(P)-binding  55.65 
 
 
361 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1601  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.93 
 
 
361 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01936  hypothetical protein  55.65 
 
 
361 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.55 
 
 
360 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1192  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.93 
 
 
361 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.428891  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.65 
 
 
354 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2456  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.64 
 
 
353 aa  385  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1616  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.08 
 
 
361 aa  381  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945868  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2330  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.52 
 
 
361 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.129575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2279  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.52 
 
 
361 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000978054 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2323  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.52 
 
 
361 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762462 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1618  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.73 
 
 
359 aa  384  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.62 
 
 
358 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.47 
 
 
352 aa  382  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.87 
 
 
358 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2332  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.49 
 
 
361 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000326666  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2437  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.52 
 
 
361 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000861453 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1398  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.67 
 
 
365 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.43 
 
 
353 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 
358 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.31 
 
 
345 aa  381  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.94 
 
 
342 aa  381  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1081  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.04 
 
 
357 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.94 
 
 
353 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0209  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.23 
 
 
350 aa  378  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3018  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  53.48 
 
 
371 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.34 
 
 
360 aa  381  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2830  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.31 
 
 
367 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00106167  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.98 
 
 
337 aa  378  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.18378  hitchhiker  0.0000000578516 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3994  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.41 
 
 
355 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1441  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.57 
 
 
362 aa  376  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.19 
 
 
348 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2222  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  53.95 
 
 
361 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0048625  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1212  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.01 
 
 
360 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  decreased coverage  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.59 
 
 
346 aa  374  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1491  dTDP-D-glucose-46-dehydratase  56.76 
 
 
352 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1986  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.47 
 
 
352 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2663  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  53.48 
 
 
362 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.47 
 
 
350 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.646368 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0482  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.6 
 
 
349 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0600  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.6 
 
 
349 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0365968  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.13 
 
 
351 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.52 
 
 
367 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.53 
 
 
339 aa  374  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.74 
 
 
352 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001808  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.1 
 
 
355 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0773  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.52 
 
 
358 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781884  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2596  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.94 
 
 
353 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4078  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.36 
 
 
346 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29374  normal  0.0761668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.81 
 
 
355 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.44 
 
 
362 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1010  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.22 
 
 
349 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.626547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3285  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.18 
 
 
353 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4812  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.78 
 
 
355 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3844  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.06 
 
 
346 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.919278  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1785  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.06 
 
 
366 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.49 
 
 
359 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.52 
 
 
355 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0926  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.02 
 
 
366 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770588  normal  0.575373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.18 
 
 
360 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2100  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.71 
 
 
357 aa  368  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564792  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0389  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.36 
 
 
353 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.4 
 
 
341 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1472  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  53.54 
 
 
356 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239272  normal  0.402949 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0871  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.36 
 
 
353 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.83298  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.47 
 
 
367 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0842  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.07 
 
 
353 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0136971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>