More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0216 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0216  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 330 aa  689    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.240285  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  74.24 
 
 		 354 aa  529  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1511  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.52 
 
 		 351 aa  501  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5840  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  70.43 
 
 		 352 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.481427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2895  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  70.43 
 
 		 351 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1995  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  70.03 
 
 		 357 aa  488  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.10362  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1911  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.08 
 
 		 355 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2291  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  69.02 
 
 		 349 aa  482  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.494545  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13118  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.09 
 
 		 350 aa  481  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399683  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1758  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.5 
 
 		 355 aa  479  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1889  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  69.94 
 
 		 345 aa  478  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0868281  hitchhiker  0.00930049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  69.82 
 
 		 350 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0354  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.38 
 
 		 348 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3391  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.69 
 
 		 354 aa  480  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.478209  normal  0.0989265 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1917  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.58 
 
 		 354 aa  478  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.20541 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.4 
 
 		 350 aa  476  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0516  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.1 
 
 		 349 aa  474  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1723  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.79 
 
 		 341 aa  471  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000370368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1778  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  66.67 
 
 		 349 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00040311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1350  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.1 
 
 		 363 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.505877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.8 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.25 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.22 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.42 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.4 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001808  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.59 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.03 
 
 		 360 aa  381  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.29 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.71 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.75 
 
 		 345 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.63 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.06 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0103955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1192  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  56.68 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.428891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.4 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1491  dTDP-D-glucose-46-dehydratase  58.01 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0243  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  55.09 
 
 		 363 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0180  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  55.09 
 
 		 363 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01947  dTDP-glucose 4,6 dehydratase, NAD(P)-binding  56.08 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.69 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.18378  hitchhiker  0.0000000578516 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.79 
 
 		 342 aa  374  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.09 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5221  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.09 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.65 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1986  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.27 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2332  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  56.38 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000326666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4299  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.09 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01936  hypothetical protein  56.08 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1601  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  56.38 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.06 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1616  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.79 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4188  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.79 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00991  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.13 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.42 
 
 		 360 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.82 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.02 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.42 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.76 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.09 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4215  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.09 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.32 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.5 
 
 		 350 aa  371  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.646368 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.95 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2106  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.03 
 
 		 350 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0474818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.72 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2830  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.35 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00106167  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2456  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.67 
 
 		 353 aa  371  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.52 
 
 		 355 aa  371  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.45 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03666  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.79 
 
 		 355 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.79 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4148  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.44 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3844  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.53 
 
 		 346 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.919278  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.64 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0701  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.65 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.004629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4133  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.44 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.91 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03615  hypothetical protein  54.79 
 
 		 355 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0209  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.41 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1272  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.27 
 
 		 351 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.447034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4202  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.14 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.79 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3502  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.16 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.33 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0516  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  54.79 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4251  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.44 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.8 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4310  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.44 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.847685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1081  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.82 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5396  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.52 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1212  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.65 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  decreased coverage  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.02 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4078  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.23 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29374  normal  0.0761668 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2330  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.44 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.129575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1183  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.97 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.769877  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0050  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.15 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2279  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.44 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000978054 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4019  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.75 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3994  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.79 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2663  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.07 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3554  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.7 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110317  normal  0.824259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>