More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1758 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1758  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 355 aa  738    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1723  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  88.53 
 
 		 341 aa  634    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000370368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1911  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  86.09 
 
 		 355 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1917  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  82.49 
 
 		 354 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.20541 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1889  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  82.89 
 
 		 345 aa  597  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0868281  hitchhiker  0.00930049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2291  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  78.9 
 
 		 349 aa  587  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.494545  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0516  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  77.68 
 
 		 349 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1778  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  79.19 
 
 		 349 aa  568  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00040311  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1995  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  77.75 
 
 		 357 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.10362  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  74.06 
 
 		 350 aa  545  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  74.64 
 
 		 350 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0354  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  73.2 
 
 		 348 aa  538  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1511  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  72.38 
 
 		 351 aa  531  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3391  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.47 
 
 		 354 aa  529  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.478209  normal  0.0989265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2895  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  72.7 
 
 		 351 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  70.77 
 
 		 354 aa  522  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13118  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.18 
 
 		 350 aa  523  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5840  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  69.83 
 
 		 352 aa  515  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.481427 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0216  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.5 
 
 		 330 aa  479  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.240285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.28 
 
 		 358 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.25 
 
 		 359 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1350  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.33 
 
 		 363 aa  434  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.505877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.59 
 
 		 358 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.1 
 
 		 362 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.05 
 
 		 357 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.47 
 
 		 356 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.34 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.3 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.43 
 
 		 357 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.18 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.07 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.85 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.43 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1441  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.46 
 
 		 362 aa  391  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3994  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.06 
 
 		 355 aa  391  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.01 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.86 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.73 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.76 
 
 		 341 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.52 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2456  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.78 
 
 		 353 aa  384  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.68 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0103955  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1618  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.1 
 
 		 359 aa  381  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.72 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.27 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.65 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.646368 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0482  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.86 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0600  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.86 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0365968  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0209  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.39 
 
 		 350 aa  381  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1010  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.25 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.626547  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01947  dTDP-glucose 4,6 dehydratase, NAD(P)-binding  53.78 
 
 		 361 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.45 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54 
 
 		 353 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.94 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1601  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  53.78 
 
 		 361 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1986  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.78 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1491  dTDP-D-glucose-46-dehydratase  57.78 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1192  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  53.78 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.428891  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3502  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.78 
 
 		 363 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01936  hypothetical protein  53.78 
 
 		 361 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001808  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.87 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.79 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2830  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.85 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00106167  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.68 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1785  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.99 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2332  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  53.22 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000326666  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1212  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.67 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  decreased coverage  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.29 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.98 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.42 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.73 
 
 		 339 aa  376  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.86 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3018  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  53.35 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.59 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.18378  hitchhiker  0.0000000578516 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1571  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.52 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.02 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1616  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.94 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.1 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1081  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.43 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4812  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.78 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.97 
 
 		 356 aa  371  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.449381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0926  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.7 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770588  normal  0.575373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2323  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.82 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762462 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.91 
 
 		 342 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.71 
 
 		 351 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.611799  normal  0.380858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2279  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.82 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000978054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2663  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  52.66 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1398  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  53.41 
 
 		 365 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2596  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.85 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2106  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.76 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0474818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1237  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.65 
 
 		 354 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.3 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.75 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2100  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.76 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.76 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0619  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.43 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2139  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.29 
 
 		 356 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.03 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3844  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.03 
 
 		 346 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.919278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>