More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0600 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0482  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  99.71 
 
 		 349 aa  720    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0600  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 349 aa  721    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0365968  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  70.94 
 
 		 356 aa  535  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.449381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.19 
 
 		 352 aa  486  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.62 
 
 		 355 aa  476  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.610294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.75 
 
 		 339 aa  472  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.84 
 
 		 348 aa  461  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2401  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.48 
 
 		 398 aa  450  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.28 
 
 		 352 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1749  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.21 
 
 		 354 aa  443  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.91 
 
 		 362 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.65 
 
 		 351 aa  434  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.611799  normal  0.380858 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.07 
 
 		 362 aa  421  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3391  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.6 
 
 		 354 aa  421  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.478209  normal  0.0989265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.38 
 
 		 358 aa  411  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2291  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.65 
 
 		 349 aa  412  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.494545  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0516  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.35 
 
 		 349 aa  412  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.88 
 
 		 358 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.65 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.2 
 
 		 350 aa  408  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.73 
 
 		 357 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1995  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.8 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.10362  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.06 
 
 		 354 aa  406  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13118  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.31 
 
 		 350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1441  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.3 
 
 		 362 aa  403  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.05 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1758  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.86 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0354  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.57 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1911  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.8 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0619  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129356 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.91 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.75 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1778  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.36 
 
 		 349 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00040311  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4166  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.86 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.167438  normal  0.0625555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.17 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.94 
 
 		 357 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1723  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.6 
 
 		 341 aa  397  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000370368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0712  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.67 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.18 
 
 		 355 aa  394  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5840  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.77 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.481427 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.14 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.86 
 
 		 350 aa  395  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.08 
 
 		 329 aa  395  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1237  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.13 
 
 		 354 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1511  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.3 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.76 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.1 
 
 		 336 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.03 
 
 		 354 aa  391  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0715  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.7 
 
 		 353 aa  391  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256455  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.23 
 
 		 336 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0277  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.02 
 
 		 352 aa  394  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.674919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2139  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.32 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2895  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.97 
 
 		 351 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0682  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  54.39 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0752  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.45 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.73 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.850535  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1917  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.84 
 
 		 354 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.20541 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3491  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.13 
 
 		 354 aa  388  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0537  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.87 
 
 		 353 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.433038  normal  0.0400591 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.46 
 
 		 353 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.68 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.724349  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1785  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.89 
 
 		 366 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.13 
 
 		 351 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1986  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.08 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.62 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1491  dTDP-D-glucose-46-dehydratase  56.08 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.98 
 
 		 318 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0503  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.47 
 
 		 351 aa  384  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0802438  normal  0.0327306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.58 
 
 		 358 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.52 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1350  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.43 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.505877  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0553  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001808  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.6 
 
 		 355 aa  384  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0253  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.87 
 
 		 352 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.430028  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1889  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.18 
 
 		 345 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0868281  hitchhiker  0.00930049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0878  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.73 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.18 
 
 		 342 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.46 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2008  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.49 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  59.2 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0274  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.94 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.89 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1081  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.72 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0926  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.61 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770588  normal  0.575373 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3163  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.16 
 
 		 400 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.3 
 
 		 358 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1469  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.16 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.793194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0923  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.16 
 
 		 400 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4022  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.44 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3727  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.44 
 
 		 353 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3803  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.15 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1714  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.44 
 
 		 353 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0640  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.26 
 
 		 353 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2753  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.16 
 
 		 400 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419146  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2735  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.12 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1618  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.78 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0761  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.45 
 
 		 353 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1797  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.44 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.12 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>