More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2401 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2401  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
398 aa  809    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.66 
 
 
356 aa  437  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.449381  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0482  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.33 
 
 
349 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0600  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.48 
 
 
349 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0365968  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.51 
 
 
355 aa  413  1e-114  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.610294  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.05 
 
 
352 aa  410  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.67 
 
 
352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.45 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1749  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.77 
 
 
354 aa  402  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.03 
 
 
351 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.611799  normal  0.380858 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.69 
 
 
339 aa  394  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.38 
 
 
362 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.87 
 
 
359 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.62 
 
 
358 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.97 
 
 
356 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.99 
 
 
362 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.87 
 
 
337 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  51.39 
 
 
360 aa  366  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.75 
 
 
355 aa  364  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.98 
 
 
342 aa  364  2e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.21 
 
 
354 aa  363  3e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.49 
 
 
355 aa  363  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.37 
 
 
356 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.724349  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.98 
 
 
358 aa  363  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.11 
 
 
357 aa  361  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1441  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.39 
 
 
362 aa  360  2e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0926  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.24 
 
 
366 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770588  normal  0.575373 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0277  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.36 
 
 
352 aa  359  5e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5840  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.09 
 
 
352 aa  358  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.481427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2222  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  46.58 
 
 
361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0048625  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2279  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  46.58 
 
 
361 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000978054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.6 
 
 
355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.35 
 
 
357 aa  357  2.9999999999999997e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2323  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  46.58 
 
 
361 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2330  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  46.58 
 
 
361 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.129575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2437  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  46.58 
 
 
361 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000861453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0837  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.33 
 
 
361 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1785  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.22 
 
 
366 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.35 
 
 
355 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3391  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.46 
 
 
354 aa  355  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.478209  normal  0.0989265 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01947  dTDP-glucose 4,6 dehydratase, NAD(P)-binding  46.95 
 
 
361 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01936  hypothetical protein  46.95 
 
 
361 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2332  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  46.21 
 
 
361 aa  353  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000326666  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0253  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.08 
 
 
352 aa  353  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.430028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.73 
 
 
351 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0712  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.22 
 
 
354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1511  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.84 
 
 
351 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.08 
 
 
354 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.7 
 
 
358 aa  352  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.61 
 
 
330 aa  352  8e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1601  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  45.94 
 
 
361 aa  351  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0537  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.58 
 
 
353 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.433038  normal  0.0400591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4022  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.23 
 
 
360 aa  351  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3491  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.37 
 
 
354 aa  351  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.370229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1237  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.99 
 
 
354 aa  351  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0715  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.49 
 
 
353 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256455  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0878  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.33 
 
 
353 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68170  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  47.84 
 
 
352 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0640014  decreased coverage  0.00283529 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.33 
 
 
357 aa  350  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3163  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.97 
 
 
400 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.94 
 
 
358 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5900  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  47.72 
 
 
352 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2895  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.61 
 
 
351 aa  350  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2753  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.97 
 
 
400 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0923  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.97 
 
 
400 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3727  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.72 
 
 
353 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1714  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.72 
 
 
353 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2735  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.84 
 
 
354 aa  348  7e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2291  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.67 
 
 
349 aa  348  8e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.494545  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.78 
 
 
360 aa  348  9e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0682  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  46.84 
 
 
354 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1917  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.72 
 
 
354 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.20541 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.97 
 
 
353 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0338476  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0354  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.84 
 
 
348 aa  348  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3105  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.97 
 
 
353 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311481  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.19 
 
 
353 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1852  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.97 
 
 
353 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.677884  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1192  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  45.69 
 
 
361 aa  348  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.428891  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.43 
 
 
354 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.97 
 
 
353 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0441  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.84 
 
 
379 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0602  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.84 
 
 
379 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.159192  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.72 
 
 
355 aa  347  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.11 
 
 
353 aa  347  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.850535  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1469  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.84 
 
 
397 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.793194  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2663  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  48.06 
 
 
362 aa  347  3e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13118  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.45 
 
 
350 aa  346  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4188  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.8 
 
 
355 aa  346  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0516  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.92 
 
 
349 aa  346  4e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3803  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.43 
 
 
350 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1616  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.43 
 
 
361 aa  345  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945868  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0553  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.07 
 
 
355 aa  346  5e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03666  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.02 
 
 
355 aa  345  6e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03615  hypothetical protein  46.02 
 
 
355 aa  345  6e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.92 
 
 
350 aa  345  7e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0640  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.95 
 
 
353 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.82 
 
 
342 aa  345  7e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5221  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.76 
 
 
355 aa  345  8e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4299  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.8 
 
 
355 aa  345  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1081  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.69 
 
 
357 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>