More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1136 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 360 aa  746    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.14 
 
 		 342 aa  501  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  70.54 
 
 		 337 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  69.62 
 
 		 341 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.51 
 
 		 356 aa  427  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.449381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.14 
 
 		 348 aa  412  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.95 
 
 		 362 aa  408  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.05 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.610294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.14 
 
 		 342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.91 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.02 
 
 		 352 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.85 
 
 		 336 aa  394  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.03 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.73 
 
 		 336 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.85 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.14 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2401  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.39 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.81 
 
 		 318 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.94 
 
 		 322 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.96 
 
 		 358 aa  381  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.63 
 
 		 322 aa  381  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.89 
 
 		 339 aa  384  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0482  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.2 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0600  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.2 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0365968  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1917  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.31 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.20541 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.32 
 
 		 322 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.7 
 
 		 322 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.01 
 
 		 322 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.7 
 
 		 322 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.39 
 
 		 353 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.01 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.86 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.23 
 
 		 329 aa  378  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5840  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.82 
 
 		 352 aa  378  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.481427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.83 
 
 		 357 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.39 
 
 		 322 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.74 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.69 
 
 		 358 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.44 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.39 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2291  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.27 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.494545  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1911  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.23 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0878  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.54 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.65 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.98 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.69 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.86 
 
 		 354 aa  371  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.13 
 
 		 353 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0338476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.56 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1778  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.84 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00040311  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0923  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.25 
 
 		 400 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3163  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.25 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.99 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1852  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.13 
 
 		 353 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.677884  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.8 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.611799  normal  0.380858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.62 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.11 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2753  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.25 
 
 		 400 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.13 
 
 		 353 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2456  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.39 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.01 
 
 		 350 aa  368  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01947  dTDP-glucose 4,6 dehydratase, NAD(P)-binding  50.82 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03666  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.15 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03615  hypothetical protein  52.15 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4188  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.15 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6255  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.82 
 
 		 353 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1749  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.67 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.14 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.15 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1469  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.7 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.793194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4299  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.15 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.15 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3803  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.99 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4215  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.15 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.83 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01936  hypothetical protein  50.82 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.46 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3105  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.13 
 
 		 353 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311481  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1995  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.57 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.10362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.42 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1601  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.1 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1192  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.1 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.428891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2895  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.3 
 
 		 351 aa  364  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3727  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.13 
 
 		 353 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1714  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.13 
 
 		 353 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.13 
 
 		 353 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.14 
 
 		 353 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0701  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.86 
 
 		 360 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.004629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0389  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.41 
 
 		 353 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2332  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.37 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000326666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0871  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.41 
 
 		 353 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.83298  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.94 
 
 		 357 aa  363  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.7 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0842  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.85 
 
 		 353 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.06 
 
 		 340 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.16 
 
 		 357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.3 
 
 		 344 aa  362  6e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2596  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 		 353 aa  362  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.99 
 
 		 356 aa  361  9e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>