More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1511 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1511  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
351 aa  729    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  76.37 
 
 
350 aa  554  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5840  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  74 
 
 
352 aa  548  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.481427 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13118  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  75.87 
 
 
350 aa  546  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0354  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  74.42 
 
 
348 aa  545  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2895  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  74.14 
 
 
351 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1917  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  73.41 
 
 
354 aa  532  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.20541 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1911  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  72.86 
 
 
355 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1758  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  72.38 
 
 
355 aa  531  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1889  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  72.62 
 
 
345 aa  528  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0868281  hitchhiker  0.00930049 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1723  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  73.18 
 
 
341 aa  528  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000370368  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1778  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.55 
 
 
349 aa  527  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00040311  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1995  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  72.13 
 
 
357 aa  527  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.10362  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2291  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  70.66 
 
 
349 aa  522  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.494545  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3391  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  70.77 
 
 
354 aa  523  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.478209  normal  0.0989265 
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  70.69 
 
 
354 aa  515  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0516  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  70.09 
 
 
349 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  69.83 
 
 
350 aa  510  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0216  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.52 
 
 
330 aa  501  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.240285  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1350  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58 
 
 
363 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.505877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.62 
 
 
357 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.36 
 
 
359 aa  425  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.51 
 
 
358 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.48 
 
 
355 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.91 
 
 
358 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.79 
 
 
362 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.75 
 
 
355 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.78 
 
 
357 aa  412  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.2 
 
 
354 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.91 
 
 
356 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.62 
 
 
355 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1441  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.62 
 
 
362 aa  400  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.33 
 
 
355 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2323  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  56.11 
 
 
361 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.81 
 
 
358 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2437  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  56.11 
 
 
361 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000861453 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2330  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.83 
 
 
361 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.129575 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0274  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.81 
 
 
351 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2279  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  56.11 
 
 
361 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000978054 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1192  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.28 
 
 
361 aa  393  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.428891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.76 
 
 
356 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0619  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.55 
 
 
355 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.73 
 
 
358 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.92 
 
 
355 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2332  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.28 
 
 
361 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000326666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1601  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55 
 
 
361 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3502  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.07 
 
 
363 aa  391  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.22 
 
 
354 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.08 
 
 
362 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.37 
 
 
359 aa  388  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1081  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.39 
 
 
357 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4019  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.13 
 
 
352 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.11 
 
 
358 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2222  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.56 
 
 
361 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0048625  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.57 
 
 
352 aa  389  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2008  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.72 
 
 
366 aa  388  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.13 
 
 
367 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.54 
 
 
358 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2139  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.98 
 
 
356 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01947  dTDP-glucose 4,6 dehydratase, NAD(P)-binding  55 
 
 
361 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01936  hypothetical protein  55 
 
 
361 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1616  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.44 
 
 
361 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945868  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1212  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.82 
 
 
360 aa  386  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  decreased coverage  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0712  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.3 
 
 
354 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.1 
 
 
354 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0103955  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0640  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.24 
 
 
353 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1398  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.57 
 
 
365 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2830  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.1 
 
 
367 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00106167  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.27 
 
 
345 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.26 
 
 
357 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5221  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.36 
 
 
355 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.65 
 
 
355 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0253  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.86 
 
 
352 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.430028  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0926  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.49 
 
 
366 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770588  normal  0.575373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.5 
 
 
354 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1272  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.14 
 
 
351 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.447034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.56 
 
 
351 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4251  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.36 
 
 
355 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3018  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  53.09 
 
 
371 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0050  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.8 
 
 
351 aa  381  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.98 
 
 
353 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2890  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54 
 
 
356 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.89 
 
 
346 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4148  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.36 
 
 
355 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00991  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.52 
 
 
360 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1318  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.39 
 
 
359 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0342732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4310  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.36 
 
 
355 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.847685  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.11 
 
 
367 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.91 
 
 
353 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1618  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.13 
 
 
359 aa  383  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4299  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.94 
 
 
355 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4133  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.36 
 
 
355 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4188  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.36 
 
 
355 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.93 
 
 
337 aa  380  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.18378  hitchhiker  0.0000000578516 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3285  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.94 
 
 
353 aa  378  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1986  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 
352 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2663  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  53.09 
 
 
362 aa  378  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2711  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.09 
 
 
356 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.07 
 
 
360 aa  381  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>