More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1618 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1618  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 359 aa  741    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4019  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.62 
 
 		 352 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.14 
 
 		 351 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0503  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.14 
 
 		 351 aa  454  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0802438  normal  0.0327306 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0209  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.72 
 
 		 350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2735  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.74 
 
 		 354 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.93 
 
 		 358 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0712  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.57 
 
 		 354 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3994  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62 
 
 		 355 aa  447  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.81 
 
 		 355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.08 
 
 		 362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0195  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.85 
 
 		 353 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5900  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  63.45 
 
 		 352 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2008  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.27 
 
 		 366 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68170  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  63.45 
 
 		 352 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0640014  decreased coverage  0.00283529 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4166  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.05 
 
 		 361 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.167438  normal  0.0625555 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0682  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  63.16 
 
 		 354 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0537  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.46 
 
 		 353 aa  437  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.433038  normal  0.0400591 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1237  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.34 
 
 		 354 aa  440  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0224  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.98 
 
 		 353 aa  437  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.724621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3491  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.1 
 
 		 354 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4022  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.25 
 
 		 360 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0773  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.71 
 
 		 358 aa  434  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.39 
 
 		 358 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2131  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.72 
 
 		 358 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.68 
 
 		 358 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0553  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.46 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0752  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.46 
 
 		 360 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0923  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.06 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5396  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.6 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.6 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1401  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  60.85 
 
 		 365 aa  432  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069994 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3163  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.06 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0120  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.73 
 
 		 353 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.29 
 
 		 353 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2753  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.06 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419146  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.43 
 
 		 352 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.17 
 
 		 356 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.724349  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1275  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.58 
 
 		 356 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3018  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  59.28 
 
 		 371 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.43 
 
 		 357 aa  430  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.7 
 
 		 353 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0338476  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1852  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.7 
 
 		 353 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.677884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.7 
 
 		 353 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2596  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.7 
 
 		 353 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3969  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.7 
 
 		 353 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00429727  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001808  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.6 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.71 
 
 		 353 aa  428  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0640  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.57 
 
 		 353 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2711  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.21 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3803  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.7 
 
 		 350 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2663  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  59.56 
 
 		 362 aa  428  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0878  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.7 
 
 		 353 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0761  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.41 
 
 		 353 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0389  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.7 
 
 		 353 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.18 
 
 		 364 aa  430  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3105  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.7 
 
 		 353 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311481  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0871  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.7 
 
 		 353 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.83298  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1081  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.35 
 
 		 357 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3285  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.58 
 
 		 353 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0842  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.41 
 
 		 353 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136971 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1469  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.41 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.793194  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.26 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0715  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.76 
 
 		 353 aa  425  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2139  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.29 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.08 
 
 		 350 aa  425  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.646368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2762  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.29 
 
 		 352 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00991  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  60.17 
 
 		 360 aa  424  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0253  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.36 
 
 		 352 aa  424  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.430028  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1398  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  58.56 
 
 		 365 aa  425  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1318  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  60.06 
 
 		 359 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0342732 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1491  dTDP-D-glucose-46-dehydratase  57.51 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.82 
 
 		 353 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1379  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  59.22 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000705991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.65 
 
 		 345 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1986  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.22 
 
 		 352 aa  421  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2106  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.38 
 
 		 350 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0474818  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.53 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1785  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.81 
 
 		 366 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.29 
 
 		 351 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0926  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.52 
 
 		 366 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770588  normal  0.575373 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2100  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.38 
 
 		 357 aa  423  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.71 
 
 		 353 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3727  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.7 
 
 		 353 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1714  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.7 
 
 		 353 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1571  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.63 
 
 		 353 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61 
 
 		 367 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2830  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.19 
 
 		 367 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00106167  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2890  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  59.15 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.64 
 
 		 354 aa  421  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.83 
 
 		 355 aa  421  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4310  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.97 
 
 		 355 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.847685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4299  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.54 
 
 		 355 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2332  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  59.43 
 
 		 361 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000326666  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0180  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  58.64 
 
 		 363 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.54 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.17 
 
 		 353 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.850535  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0243  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  58.64 
 
 		 363 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1601  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  59.43 
 
 		 361 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>