More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0861 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
337 aa  697    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.18378  hitchhiker  0.0000000578516 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1797  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.73 
 
 
338 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1785  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  70.61 
 
 
346 aa  504  1e-141  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0304  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.1 
 
 
345 aa  454  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.92366  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1064  hypothetical protein  62.46 
 
 
337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.732456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0878  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.82 
 
 
353 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.36 
 
 
358 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0712  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.93 
 
 
354 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3803  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.21 
 
 
350 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3383  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.49 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2139  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.91 
 
 
356 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3969  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.01 
 
 
353 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00429727  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0619  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.12 
 
 
355 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129356 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.61 
 
 
353 aa  401  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.66 
 
 
351 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6250  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.19 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.030258  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0640  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.31 
 
 
353 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0682  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  58.73 
 
 
354 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.56 
 
 
355 aa  398  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3163  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.44 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2100  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.14 
 
 
357 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564792  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0923  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.44 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2106  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.59 
 
 
350 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0474818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3727  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.31 
 
 
353 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1714  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.31 
 
 
353 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0761  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.7 
 
 
353 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2753  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.44 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.7 
 
 
353 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.7 
 
 
353 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0338476  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2596  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.31 
 
 
353 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.81 
 
 
362 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3105  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.7 
 
 
353 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311481  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2008  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.98 
 
 
366 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13118  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.91 
 
 
350 aa  396  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399683  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0553  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.83 
 
 
355 aa  394  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1852  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.7 
 
 
353 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.677884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2735  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.53 
 
 
354 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6417  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.19 
 
 
338 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3554  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.88 
 
 
355 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110317  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0537  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.43 
 
 
353 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.433038  normal  0.0400591 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6652  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.19 
 
 
338 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1785  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.02 
 
 
366 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0503  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.88 
 
 
351 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0802438  normal  0.0327306 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0824  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  56.76 
 
 
359 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0795  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  56.46 
 
 
359 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0926  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.02 
 
 
366 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770588  normal  0.575373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1469  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.55 
 
 
397 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.793194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0842  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.7 
 
 
353 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0136971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0389  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.01 
 
 
353 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.01 
 
 
353 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4166  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.61 
 
 
361 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.167438  normal  0.0625555 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0871  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.01 
 
 
353 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.83298  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1618  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.89 
 
 
359 aa  388  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0773  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.46 
 
 
358 aa  388  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3994  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.14 
 
 
355 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68170  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  57.23 
 
 
352 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0640014  decreased coverage  0.00283529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.1 
 
 
354 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0752  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.8 
 
 
360 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.55 
 
 
355 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.31 
 
 
356 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.724349  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1237  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.73 
 
 
354 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5900  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  57.23 
 
 
352 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.65 
 
 
350 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0050  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.76 
 
 
351 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.25 
 
 
355 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0253  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.23 
 
 
352 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.430028  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.85 
 
 
355 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.3 
 
 
355 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0277  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.53 
 
 
352 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.85 
 
 
355 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0354  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.93 
 
 
348 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.16 
 
 
357 aa  381  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.57 
 
 
354 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.76 
 
 
356 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0516  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.76 
 
 
349 aa  383  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.97 
 
 
362 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.8 
 
 
353 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.850535  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.93 
 
 
346 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0715  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.83 
 
 
353 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256455  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.85 
 
 
367 aa  381  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4022  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.4 
 
 
360 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0195  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.06 
 
 
353 aa  381  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3285  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.36 
 
 
353 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0516  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  56.55 
 
 
355 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3391  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.29 
 
 
354 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.478209  normal  0.0989265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  56.6 
 
 
359 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.99 
 
 
357 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.45 
 
 
354 aa  381  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.06 
 
 
362 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1723  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.98 
 
 
341 aa  378  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000370368  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4812  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.06 
 
 
355 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.93 
 
 
351 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.01 
 
 
360 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.19 
 
 
358 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1511  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.93 
 
 
351 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.19 
 
 
358 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3491  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.8 
 
 
354 aa  378  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.370229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1275  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.63 
 
 
356 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.52 
 
 
350 aa  378  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.646368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1318  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.72 
 
 
359 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0342732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>