More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8193 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8193  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
338 aa  693    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.95 
 
 
330 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.63 
 
 
330 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4331  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.14 
 
 
331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0415  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.16 
 
 
324 aa  402  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.021137  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4211  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.61 
 
 
331 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2246  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.99 
 
 
324 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.844731  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2363  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.37 
 
 
324 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.69 
 
 
336 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6490  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.8 
 
 
325 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2222  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.38 
 
 
335 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.08 
 
 
357 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.31 
 
 
318 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.79 
 
 
330 aa  362  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.83 
 
 
320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.12 
 
 
318 aa  354  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.15 
 
 
342 aa  350  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.09 
 
 
323 aa  349  4e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.85 
 
 
327 aa  348  7e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.24 
 
 
322 aa  347  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.19 
 
 
329 aa  347  1e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.62 
 
 
322 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.62 
 
 
322 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0632  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.96 
 
 
340 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.62 
 
 
322 aa  346  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.31 
 
 
323 aa  345  6e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.31 
 
 
322 aa  344  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.31 
 
 
322 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
322 aa  342  5e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
323 aa  341  9e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.08 
 
 
342 aa  341  1e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.41 
 
 
340 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.07 
 
 
336 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.95 
 
 
340 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0307  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.13 
 
 
339 aa  333  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.3 
 
 
362 aa  332  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1124  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.62 
 
 
323 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0644506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.06 
 
 
336 aa  329  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.73 
 
 
358 aa  328  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.44 
 
 
336 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.61 
 
 
330 aa  328  7e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.77 
 
 
318 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.11 
 
 
340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.06 
 
 
336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.48 
 
 
358 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.4 
 
 
352 aa  322  6e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.06 
 
 
356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5789  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.81 
 
 
331 aa  319  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0435819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.86 
 
 
344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.06 
 
 
341 aa  317  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.6 
 
 
359 aa  316  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.62 
 
 
341 aa  315  6e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.3 
 
 
357 aa  315  8e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.76 
 
 
354 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.4 
 
 
342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.26 
 
 
355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.45 
 
 
337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.9 
 
 
312 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.56 
 
 
355 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.94 
 
 
356 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.49 
 
 
357 aa  311  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.65 
 
 
354 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3994  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.71 
 
 
355 aa  309  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  49.85 
 
 
360 aa  309  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.28 
 
 
334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2456  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.71 
 
 
353 aa  305  7e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.65 
 
 
354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0682  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  48.05 
 
 
354 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1217  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.68 
 
 
308 aa  301  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2563  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.11 
 
 
331 aa  301  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.77 
 
 
323 aa  300  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.7 
 
 
307 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2146  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
308 aa  300  3e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1568  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  48.82 
 
 
340 aa  300  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3554  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.25 
 
 
355 aa  299  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110317  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.84 
 
 
307 aa  298  8e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0926  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.7 
 
 
366 aa  298  9e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770588  normal  0.575373 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2596  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.05 
 
 
353 aa  298  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.7 
 
 
348 aa  298  1e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2411  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.77 
 
 
332 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.261098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.75 
 
 
353 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.1 
 
 
358 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0878  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.45 
 
 
353 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0120  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.39 
 
 
353 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0050  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.04 
 
 
351 aa  296  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.71 
 
 
355 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2735  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.15 
 
 
354 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1272  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.24 
 
 
351 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.447034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3803  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.85 
 
 
350 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2097  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.59 
 
 
347 aa  295  8e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.56 
 
 
357 aa  295  9e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.68 
 
 
355 aa  295  9e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0842  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.45 
 
 
353 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0136971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.71 
 
 
355 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4723  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.21 
 
 
356 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234117 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0389  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.45 
 
 
353 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.09 
 
 
367 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0871  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.45 
 
 
353 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.83298  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.19 
 
 
350 aa  294  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3054  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.2 
 
 
350 aa  293  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>