More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3079 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3079  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
342 aa  704    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.544275  unclonable  0.000000030667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3431  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  72.4 
 
 
337 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  70.92 
 
 
350 aa  509  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.79 
 
 
342 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.91 
 
 
318 aa  368  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.24 
 
 
331 aa  363  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.41 
 
 
336 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.78 
 
 
322 aa  355  5e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.47 
 
 
322 aa  355  5e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.47 
 
 
322 aa  354  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
323 aa  354  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.15 
 
 
337 aa  354  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.44 
 
 
330 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.16 
 
 
322 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.63 
 
 
342 aa  353  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.948095  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.16 
 
 
322 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.68 
 
 
342 aa  353  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
322 aa  352  7e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.57 
 
 
318 aa  351  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.47 
 
 
322 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
323 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.85 
 
 
356 aa  350  2e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.449381  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.51 
 
 
336 aa  349  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.51 
 
 
336 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.9 
 
 
336 aa  345  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.2 
 
 
323 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.9 
 
 
344 aa  344  1e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.88 
 
 
334 aa  343  2e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.94 
 
 
318 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.52 
 
 
320 aa  342  8e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.45 
 
 
341 aa  341  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.57 
 
 
348 aa  341  1e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.13 
 
 
362 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
352 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.71 
 
 
329 aa  338  9.999999999999999e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.53 
 
 
312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.84 
 
 
352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.27 
 
 
327 aa  335  7e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5789  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.38 
 
 
331 aa  334  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0435819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.99 
 
 
354 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.86 
 
 
357 aa  332  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2113  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.94 
 
 
361 aa  329  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.663781 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.01 
 
 
362 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.99 
 
 
355 aa  328  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.82 
 
 
341 aa  328  6e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1124  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
323 aa  328  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0644506  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  49.7 
 
 
360 aa  328  6e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0277  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.29 
 
 
352 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1441  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.85 
 
 
362 aa  327  1.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.15 
 
 
354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.7 
 
 
351 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.611799  normal  0.380858 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0415  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.19 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.021137  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.7 
 
 
355 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.85 
 
 
355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1749  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.01 
 
 
354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.6 
 
 
307 aa  325  5e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0253  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
352 aa  324  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.430028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.28 
 
 
355 aa  323  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.14 
 
 
354 aa  323  4e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.55 
 
 
339 aa  322  6e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.28 
 
 
356 aa  322  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6490  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.39 
 
 
325 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2146  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.72 
 
 
308 aa  322  7e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.28 
 
 
358 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.01 
 
 
355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.85 
 
 
340 aa  320  3e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0354  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.26 
 
 
348 aa  319  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1350  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.56 
 
 
363 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.505877  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.23 
 
 
330 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4022  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.71 
 
 
360 aa  317  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.13 
 
 
307 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3235  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.15 
 
 
352 aa  317  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.07 
 
 
330 aa  316  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.15 
 
 
355 aa  315  7e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0752  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.14 
 
 
360 aa  315  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.71 
 
 
357 aa  315  7e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3994  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.14 
 
 
355 aa  315  9e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.09 
 
 
323 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1917  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.99 
 
 
354 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.20541 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.52 
 
 
340 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0619  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.46 
 
 
355 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129356 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2291  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.84 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.494545  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0482  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.26 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0600  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.26 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0365968  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.89 
 
 
356 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.724349  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.29 
 
 
357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
330 aa  312  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.81 
 
 
358 aa  312  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.84 
 
 
355 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.26 
 
 
351 aa  311  7.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0712  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.44 
 
 
354 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0640  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.43 
 
 
353 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0540  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.75 
 
 
363 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.48 
 
 
355 aa  311  1e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.610294  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.12 
 
 
358 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0516  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.84 
 
 
349 aa  310  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.44 
 
 
353 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.850535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.96 
 
 
359 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0120  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.65 
 
 
353 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4310  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.13 
 
 
355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.847685  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>