More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1046 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  100 
 
 
345 aa  711    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.86 
 
 
356 aa  472  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.77 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  48.15 
 
 
352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.6 
 
 
346 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.66 
 
 
346 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.37 
 
 
349 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.05 
 
 
350 aa  208  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.84 
 
 
349 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.22 
 
 
351 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.07 
 
 
350 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  36.65 
 
 
351 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.08 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  36.73 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.6 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.07 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.21 
 
 
342 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.48 
 
 
338 aa  196  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.8 
 
 
353 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.42 
 
 
342 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.68 
 
 
352 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.83 
 
 
342 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.04 
 
 
353 aa  192  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.16 
 
 
351 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.78 
 
 
342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.76 
 
 
336 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  39.29 
 
 
326 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.62 
 
 
342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
347 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 
322 aa  170  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
312 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.68 
 
 
344 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  33.68 
 
 
346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
510 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
312 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
368 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
342 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 
459 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 
315 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.41 
 
 
724 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
325 aa  125  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
342 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.21 
 
 
315 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 
328 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.5 
 
 
337 aa  113  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 
346 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
325 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 
310 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
330 aa  102  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
310 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
310 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 
319 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
321 aa  92.8  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
309 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  27.41 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  30.9 
 
 
330 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  27.3 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  29.58 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  29.39 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  30.34 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  28.62 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  30.4 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1718  UDP-glucose 4-epimerase  29.54 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.818272  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  27.73 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  29.66 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 
311 aa  77  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  28.84 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  29.47 
 
 
331 aa  77  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  28.9 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
308 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2760  UDP-galactose 4-epimerase  29.97 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467809  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  26.28 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  28.42 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  30.34 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  27.6 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  28.52 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  29.08 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.01 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  26.96 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.67 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3334  UDP-glucose 4-epimerase  27.54 
 
 
342 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.618075  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.03 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  26.1 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  28.72 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  29.1 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>