More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0378 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  91.78 
 
 
353 aa  652    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  100 
 
 
326 aa  674    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  84.14 
 
 
353 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.48 
 
 
350 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.18 
 
 
349 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.46 
 
 
336 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.06 
 
 
346 aa  324  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.15 
 
 
346 aa  322  8e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.44 
 
 
349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.61 
 
 
342 aa  298  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.75 
 
 
342 aa  288  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.76 
 
 
338 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.43 
 
 
352 aa  279  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.01 
 
 
347 aa  278  8e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.66 
 
 
342 aa  276  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  48.22 
 
 
347 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.24 
 
 
340 aa  275  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  40.83 
 
 
342 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.31 
 
 
342 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.7 
 
 
350 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.12 
 
 
353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.48 
 
 
342 aa  261  8e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  40.59 
 
 
351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.29 
 
 
351 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.88 
 
 
351 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.72 
 
 
356 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 
459 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.04 
 
 
368 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.18 
 
 
342 aa  179  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.98 
 
 
322 aa  179  7e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.11 
 
 
724 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.35 
 
 
501 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  39.29 
 
 
345 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 
342 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.85 
 
 
510 aa  175  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.4 
 
 
344 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  37.4 
 
 
346 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.37 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.37 
 
 
312 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  34.13 
 
 
352 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.12 
 
 
315 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  34.18 
 
 
312 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.33 
 
 
330 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.28 
 
 
315 aa  153  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.91 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.21 
 
 
328 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
346 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  31.58 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  30.83 
 
 
312 aa  116  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
309 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 
310 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 
310 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
321 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  31.4 
 
 
327 aa  99.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
314 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  29.2 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  32.84 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  30.92 
 
 
328 aa  92.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 
312 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  32.1 
 
 
318 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  26.3 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  28.07 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  29.89 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
334 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16038  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  27.04 
 
 
328 aa  86.3  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2451  UDP-glucose 4-epimerase  31.46 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0563953  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  25.56 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  29.3 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  30.45 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  31.88 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  25.55 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  29.55 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  29.34 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  29.26 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  28.78 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  28.36 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0706  putative epimerase/dehydratase family protein  29.34 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  28.85 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  28.85 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 
292 aa  79  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  28.62 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  29.93 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5389  UDP-glucose 4-epimerase  31.25 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.925901  hitchhiker  0.00813598 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  28.89 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3334  UDP-glucose 4-epimerase  30.32 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.618075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  28.68 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  30.48 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>