More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0986 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
368 aa  754    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.94 
 
 
344 aa  243  5e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  39.64 
 
 
346 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.21 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.3 
 
 
342 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.87 
 
 
724 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.77 
 
 
340 aa  215  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.42 
 
 
350 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.81 
 
 
338 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.77 
 
 
349 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.82 
 
 
342 aa  210  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.47 
 
 
342 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.94 
 
 
347 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.43 
 
 
510 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.54 
 
 
337 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.14 
 
 
342 aa  206  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.65 
 
 
352 aa  205  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.19 
 
 
346 aa  199  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.49 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.5 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.72 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.89 
 
 
347 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.42 
 
 
342 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  38.71 
 
 
353 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 
501 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 
353 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.85 
 
 
336 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 
342 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
351 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  37.22 
 
 
351 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 
346 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.79 
 
 
353 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.94 
 
 
351 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.72 
 
 
342 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  39.04 
 
 
326 aa  179  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  34.26 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
312 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.69 
 
 
312 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.64 
 
 
315 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
459 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 
346 aa  162  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
330 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.59 
 
 
348 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  30.7 
 
 
352 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.21 
 
 
325 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.85 
 
 
356 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
309 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  31.35 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.16 
 
 
310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.16 
 
 
310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  31.66 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 
310 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
319 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.84 
 
 
321 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  27.55 
 
 
314 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
309 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
325 aa  97.4  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
311 aa  96.3  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
310 aa  95.9  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.61 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.61 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
333 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.28 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.2 
 
 
310 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 
310 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
311 aa  92.8  9e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
328 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 
308 aa  92  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  29.92 
 
 
308 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
324 aa  89.7  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.51 
 
 
312 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
327 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0248  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
340 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.250219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
306 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
313 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 
305 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
302 aa  86.7  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  28 
 
 
329 aa  86.3  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  30.03 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  26.97 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  26.97 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  30 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.55139  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0795  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.03 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
313 aa  84  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
309 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.13 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.19 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>