More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5187 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
350 aa  732    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  74.41 
 
 
342 aa  552  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.73 
 
 
347 aa  545  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.12 
 
 
342 aa  511  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.21 
 
 
342 aa  502  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.41 
 
 
342 aa  473  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.12 
 
 
342 aa  468  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.54 
 
 
353 aa  465  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.13 
 
 
352 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  54.84 
 
 
351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.55 
 
 
351 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.55 
 
 
351 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.57 
 
 
350 aa  348  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.41 
 
 
349 aa  342  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.88 
 
 
346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.81 
 
 
336 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  49.39 
 
 
347 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  43.45 
 
 
353 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.46 
 
 
338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.88 
 
 
346 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.94 
 
 
342 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.51 
 
 
349 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.05 
 
 
353 aa  296  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.43 
 
 
340 aa  289  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  39.7 
 
 
326 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  37.95 
 
 
346 aa  216  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.95 
 
 
344 aa  216  4e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 
322 aa  216  5e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.99 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.89 
 
 
356 aa  209  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.51 
 
 
342 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.56 
 
 
348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.72 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  37.07 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 
501 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.79 
 
 
459 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.75 
 
 
510 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.63 
 
 
724 aa  182  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 
346 aa  179  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  32.1 
 
 
352 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 
312 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
312 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 
330 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
328 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  34.41 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.93 
 
 
315 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.93 
 
 
337 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 
315 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
325 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
310 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  28.75 
 
 
313 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  28.44 
 
 
312 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.63 
 
 
310 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.63 
 
 
310 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
309 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
334 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  29.58 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  29.37 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  29.01 
 
 
328 aa  90.1  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
327 aa  90.1  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  28.37 
 
 
331 aa  89.7  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  24.6 
 
 
314 aa  89.7  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  29.82 
 
 
328 aa  89.4  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  27.33 
 
 
323 aa  88.6  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
326 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.39 
 
 
328 aa  87.8  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
314 aa  87.4  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
321 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
312 aa  86.3  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  28.78 
 
 
329 aa  86.3  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  29.04 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  28.16 
 
 
327 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1537  UDP-glucose 4-epimerase  27.05 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  24.25 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.7 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2141  UDP-glucose 4-epimerase  27.96 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1392  UDP-glucose 4-epimerase  29.43 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  24.25 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  24.92 
 
 
338 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  24.25 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  29.45 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3550  UDP-galactose 4-epimerase  26.18 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.211522 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  24.07 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  24.92 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  24.7 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  24.07 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  27.74 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  27.31 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  24.25 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  28.25 
 
 
319 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  24.25 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4161  UDP-galactose 4-epimerase  29.67 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00395253  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>