More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4161 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4161  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 334 aa  674    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00395253  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2141  UDP-glucose 4-epimerase  67.27 
 
 		 334 aa  465  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1106  UDP-glucose 4-epimerase  65.17 
 
 		 337 aa  450  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.675883  normal  0.914714 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  43.08 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  40.24 
 
 		 338 aa  239  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  40.31 
 
 		 332 aa  238  9e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1728  UDP-glucose 4-epimerase  38.39 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  42.07 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  39.82 
 
 		 338 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0923  UDP-glucose 4-epimerase  39.17 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000616826  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  41.77 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  38.64 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0994  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.44 
 
 		 624 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165504  decreased coverage  0.00173885 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  39.74 
 
 		 323 aa  229  7e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  41.16 
 
 		 337 aa  228  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  40.25 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  43.87 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  39.19 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  37.76 
 
 		 332 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  41.56 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  38.79 
 
 		 329 aa  225  9e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  39.51 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  38.04 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  37.12 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  40.06 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  41.54 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  39.07 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  39.71 
 
 		 339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  40.48 
 
 		 329 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  40.66 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  36.53 
 
 		 326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  36.36 
 
 		 325 aa  222  6e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  41.23 
 
 		 329 aa  222  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  38.25 
 
 		 336 aa  222  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  39.53 
 
 		 338 aa  222  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  35.24 
 
 		 337 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  39.76 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  42.9 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  38.58 
 
 		 353 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  36.2 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  39.26 
 
 		 344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  40.25 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  39.38 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  34.94 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  38.82 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  39.13 
 
 		 339 aa  220  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  39.02 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  38.99 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  38.11 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  38.72 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  36.97 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2591  UDP-galactose 4-epimerase  40.77 
 
 		 337 aa  219  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496154  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  38.53 
 
 		 338 aa  219  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  37.09 
 
 		 337 aa  219  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  37.39 
 
 		 337 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  39.81 
 
 		 324 aa  218  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0347  UDP-glucose 4-epimerase  38.84 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0730081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  37.28 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  39.94 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  42.58 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  37.76 
 
 		 332 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46785  UDP-glucose 4-epimerase  38.17 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  37.09 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2855  UDP-galactose-4-epimerase  39.13 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  39.57 
 
 		 327 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2943  UDP-galactose-4-epimerase  39.13 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  39.26 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  38.46 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  39.17 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  41.27 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03925  UDP-glucose 4-epimerase  36.58 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.317311  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  37.75 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  41.46 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  37.15 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  39.63 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  38.01 
 
 		 342 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  41.16 
 
 		 337 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1413  UDP-galactose-4-epimerase  38.84 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  41.46 
 
 		 328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  38.58 
 
 		 350 aa  215  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  35.6 
 
 		 321 aa  215  7e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  38.86 
 
 		 340 aa  215  7e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  38.58 
 
 		 328 aa  215  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  39.02 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  37.16 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  39.71 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0168  UDP-glucose 4-epimerase  41.72 
 
 		 342 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  36.94 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  37.65 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  37.65 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  36.66 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  39.76 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  35.71 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  35.45 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  38.34 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  35.78 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  39.33 
 
 		 336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  39.08 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  38.41 
 
 		 327 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  39.69 
 
 		 337 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>