More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1106 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1106  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 337 aa  692    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.675883  normal  0.914714 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2141  UDP-glucose 4-epimerase  88.92 
 
 		 334 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4161  UDP-galactose 4-epimerase  65.17 
 
 		 334 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00395253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0994  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.48 
 
 		 624 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165504  decreased coverage  0.00173885 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  40.41 
 
 		 338 aa  242  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  40.61 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  40.99 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  41.37 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  39.94 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  40.18 
 
 		 339 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0182  UDP-glucose 4-epimerase  41.74 
 
 		 342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  39.88 
 
 		 337 aa  235  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1728  UDP-glucose 4-epimerase  37.5 
 
 		 338 aa  235  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  39.88 
 
 		 337 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  41.84 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0923  UDP-glucose 4-epimerase  37.8 
 
 		 341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000616826  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  39.58 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  40.55 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  41.37 
 
 		 339 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  39.94 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  41.37 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  39.58 
 
 		 337 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  39.58 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  42.18 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  40.83 
 
 		 342 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  40.48 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  39.88 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  39.88 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  39.05 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  39.05 
 
 		 338 aa  229  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  39.88 
 
 		 337 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  39.05 
 
 		 338 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  39.58 
 
 		 337 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  41.19 
 
 		 329 aa  228  9e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  39.35 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  39.04 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  39.58 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  38.39 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  42.09 
 
 		 338 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  39.04 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2339  UDP-galactose 4-epimerase  40.06 
 
 		 349 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569597  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  39.64 
 
 		 339 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  40.72 
 
 		 340 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  40.42 
 
 		 340 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  39.71 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  39.71 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  38.46 
 
 		 338 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  41.84 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  38.76 
 
 		 338 aa  226  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  41.44 
 
 		 337 aa  226  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0347  UDP-glucose 4-epimerase  39.88 
 
 		 342 aa  225  7e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0730081 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  40.24 
 
 		 338 aa  225  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  38.46 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  40.36 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  42.22 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2591  UDP-galactose 4-epimerase  40.48 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496154  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  40.83 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  40.49 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  39.76 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  38.42 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  40.55 
 
 		 326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  40.06 
 
 		 333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  38.69 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  41.07 
 
 		 337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  38.39 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  41.72 
 
 		 336 aa  222  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  41.36 
 
 		 351 aa  222  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  40.36 
 
 		 339 aa  222  9e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  39.88 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  40.18 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  39.82 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  39.82 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  39.77 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  39.52 
 
 		 340 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2971  UDP-glucose 4-epimerase  41.74 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.86287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  35.78 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  41.77 
 
 		 329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  40.72 
 
 		 340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2704  UDP-glucose 4-epimerase  38.51 
 
 		 342 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647112  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  40.77 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  39.88 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  38.58 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  38.97 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  39.71 
 
 		 373 aa  219  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  37.87 
 
 		 338 aa  219  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  38.44 
 
 		 338 aa  219  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  39.64 
 
 		 338 aa  219  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  40.31 
 
 		 324 aa  218  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  40.72 
 
 		 340 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  40.72 
 
 		 340 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  40.72 
 
 		 340 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  40.72 
 
 		 339 aa  218  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  39.58 
 
 		 340 aa  218  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  39.57 
 
 		 331 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  40.6 
 
 		 336 aa  218  8.999999999999998e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  37.57 
 
 		 353 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  38.17 
 
 		 342 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  39.65 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  38.91 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  39.88 
 
 		 338 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>