More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2704 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2704  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 342 aa  707    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647112  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2900  UDP-glucose 4-epimerase  88.6 
 
 		 342 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2339  UDP-galactose 4-epimerase  63.69 
 
 		 349 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569597  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  63.17 
 
 		 373 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  62.09 
 
 		 342 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  61.31 
 
 		 352 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  58.51 
 
 		 336 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  57.31 
 
 		 337 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  57.01 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2824  UDP-galactose 4-epimerase  58.33 
 
 		 351 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  57.31 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  56.72 
 
 		 337 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  56.72 
 
 		 337 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  56.42 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  56.89 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  57.31 
 
 		 337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  56.72 
 
 		 337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  56.12 
 
 		 337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  56.72 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  57.01 
 
 		 337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  56.42 
 
 		 337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  55.09 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  55.99 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  54.73 
 
 		 341 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  56.59 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  56.84 
 
 		 335 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  56.42 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  55.69 
 
 		 338 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  55.69 
 
 		 338 aa  391  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  53.43 
 
 		 338 aa  391  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  57.19 
 
 		 338 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  53.89 
 
 		 338 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  57.19 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  56.68 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  54.63 
 
 		 336 aa  391  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  55.06 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  53.59 
 
 		 338 aa  384  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  55.22 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  53.13 
 
 		 339 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  52.99 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  52.99 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  52.99 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  53.59 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  51.64 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  53.73 
 
 		 337 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  52.99 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  51.64 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  52.99 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  55.82 
 
 		 339 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  53.13 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  52.99 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  52.99 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  52.99 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  52.4 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  52.4 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  55.69 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1234  UDP-glucose 4-epimerase  57.49 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0382166  normal  0.453706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  55.95 
 
 		 340 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  51.64 
 
 		 338 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2943  UDP-galactose-4-epimerase  53.89 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  51.64 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2855  UDP-galactose-4-epimerase  53.89 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  52.4 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  55.06 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  54.79 
 
 		 337 aa  378  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  55.69 
 
 		 337 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  51.64 
 
 		 338 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  52.54 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  55.18 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2285  UDP-glucose 4-epimerase  55.99 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  51.94 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  54.76 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  54.79 
 
 		 340 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  54.79 
 
 		 340 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1601  UDP-glucose 4-epimerase  54.17 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383307  normal  0.0692735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  52.99 
 
 		 340 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  51.94 
 
 		 342 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  54.33 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1413  UDP-galactose-4-epimerase  53.59 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  53.29 
 
 		 340 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2911  UDP-glucose 4-epimerase  55.16 
 
 		 342 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  54.19 
 
 		 340 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  52.24 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  52.99 
 
 		 335 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  52.24 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5166  UDP-glucose 4-epimerase  52.84 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1537  UDP-glucose 4-epimerase  54.43 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  53.18 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  53.89 
 
 		 340 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  54.19 
 
 		 340 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  53.89 
 
 		 340 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  53.89 
 
 		 340 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>