More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0994 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0994  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
624 aa  1264    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165504  decreased coverage  0.00173885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8186  glycosyl transferase family 2  52.51 
 
 
299 aa  331  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2141  UDP-glucose 4-epimerase  46.67 
 
 
334 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2683  glycosyl transferase family protein  42.09 
 
 
295 aa  256  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2415  glycosyl transferase family 2  44.6 
 
 
293 aa  252  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1106  UDP-glucose 4-epimerase  44.48 
 
 
337 aa  246  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.675883  normal  0.914714 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0603  glycosyl transferase family 2  48.9 
 
 
282 aa  231  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4161  UDP-galactose 4-epimerase  49.44 
 
 
334 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00395253  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2567  glycosyl transferase family 2  45.95 
 
 
295 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.852695  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4200  glycosyl transferase family 2  45.14 
 
 
317 aa  216  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.852647  normal  0.242959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8179  glycosyl transferase family 2  39.79 
 
 
299 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  37.17 
 
 
323 aa  164  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  36.88 
 
 
344 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  36.31 
 
 
326 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  36.45 
 
 
327 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  36.56 
 
 
344 aa  163  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  37.31 
 
 
333 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  36.47 
 
 
326 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  36.14 
 
 
327 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  37.38 
 
 
330 aa  161  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  40.22 
 
 
332 aa  160  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  41.2 
 
 
339 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  34.69 
 
 
324 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  42.44 
 
 
328 aa  158  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  33.75 
 
 
330 aa  157  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  33.64 
 
 
332 aa  157  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3696  UDP-glucose 4-epimerase  36.45 
 
 
329 aa  156  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0207521 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
327 aa  156  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  37.3 
 
 
328 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  38.08 
 
 
338 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  34.18 
 
 
337 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  32.95 
 
 
353 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  34.67 
 
 
335 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  34.02 
 
 
332 aa  153  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  36.34 
 
 
330 aa  153  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  35.37 
 
 
336 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  36.52 
 
 
336 aa  153  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  34.25 
 
 
329 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  33.83 
 
 
338 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  33.86 
 
 
337 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  35.35 
 
 
328 aa  152  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  35.08 
 
 
337 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  37.54 
 
 
340 aa  152  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  30.7 
 
 
326 aa  151  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  38.73 
 
 
338 aa  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  34.27 
 
 
327 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  38.72 
 
 
323 aa  151  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1601  UDP-glucose 4-epimerase  33.03 
 
 
337 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383307  normal  0.0692735 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  34.89 
 
 
332 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  36.31 
 
 
329 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  34.22 
 
 
339 aa  151  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  34.33 
 
 
332 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  36.52 
 
 
339 aa  151  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  32.93 
 
 
338 aa  151  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  39.41 
 
 
327 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2451  UDP-glucose 4-epimerase  34.87 
 
 
341 aa  150  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0563953  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  31.91 
 
 
324 aa  150  7e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  37.24 
 
 
327 aa  150  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  36.65 
 
 
339 aa  150  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  35.88 
 
 
339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  36.36 
 
 
335 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  34.58 
 
 
329 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  39.33 
 
 
327 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  32.84 
 
 
333 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  33.43 
 
 
329 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  32.51 
 
 
338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  35.6 
 
 
331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  33.93 
 
 
332 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  35.61 
 
 
350 aa  148  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  33.94 
 
 
331 aa  148  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2943  UDP-galactose-4-epimerase  37.81 
 
 
338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  34.78 
 
 
332 aa  148  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2855  UDP-galactose-4-epimerase  37.81 
 
 
338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  41.74 
 
 
330 aa  147  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  35.31 
 
 
335 aa  147  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  35.45 
 
 
339 aa  147  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  34.27 
 
 
327 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  34.27 
 
 
327 aa  146  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0168  UDP-glucose 4-epimerase  39.31 
 
 
342 aa  146  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0347  UDP-glucose 4-epimerase  37.05 
 
 
342 aa  146  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0730081 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  32.09 
 
 
324 aa  146  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  39.93 
 
 
330 aa  146  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  35.5 
 
 
337 aa  146  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  35.31 
 
 
330 aa  146  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1413  UDP-galactose-4-epimerase  37.46 
 
 
338 aa  146  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  38.08 
 
 
338 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  33.96 
 
 
331 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2015  UDP-glucose 4-epimerase  35.82 
 
 
339 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  29.91 
 
 
325 aa  145  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  33.43 
 
 
330 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  35.94 
 
 
338 aa  144  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  37.18 
 
 
322 aa  144  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  38.57 
 
 
330 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  35.24 
 
 
349 aa  144  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  35.1 
 
 
337 aa  144  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  28.31 
 
 
328 aa  144  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  35.34 
 
 
351 aa  144  7e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  37.11 
 
 
337 aa  143  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  36.42 
 
 
336 aa  143  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4998  UDP-glucose 4-epimerase  33.75 
 
 
330 aa  143  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163773  normal  0.0224202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>