More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2141 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2141  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 334 aa  682    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1106  UDP-glucose 4-epimerase  88.92 
 
 		 337 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.675883  normal  0.914714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4161  UDP-galactose 4-epimerase  67.27 
 
 		 334 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00395253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0994  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.67 
 
 		 624 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165504  decreased coverage  0.00173885 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  41.54 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  41.89 
 
 		 338 aa  245  6.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0182  UDP-glucose 4-epimerase  41.74 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  39.64 
 
 		 337 aa  236  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  40.85 
 
 		 337 aa  235  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1728  UDP-glucose 4-epimerase  37.8 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87625  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  39 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  40.64 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  39.64 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  39.64 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  41.89 
 
 		 337 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  39.34 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  39.64 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  38.82 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  39.64 
 
 		 337 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0923  UDP-glucose 4-epimerase  38.39 
 
 		 341 aa  229  7e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000616826  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2591  UDP-galactose 4-epimerase  40.83 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496154  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4069  hypothetical protein  40.79 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.487038  normal  0.116036 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  39.94 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  39.33 
 
 		 332 aa  228  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  39.58 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  40.77 
 
 		 339 aa  227  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  39.64 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  39.34 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  39.35 
 
 		 338 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  39.34 
 
 		 337 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  38.94 
 
 		 338 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  39.47 
 
 		 341 aa  224  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  39.04 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  38.64 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  39.47 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2971  UDP-glucose 4-epimerase  42.34 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.86287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0168  UDP-glucose 4-epimerase  42.07 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  37.79 
 
 		 338 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  40.53 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  40 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  40.29 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2339  UDP-galactose 4-epimerase  40.3 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569597  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  39.65 
 
 		 339 aa  223  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  38.64 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  40.6 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  40.18 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  37.2 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  40.24 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  40.43 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  40.37 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  38.35 
 
 		 338 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  38.39 
 
 		 337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  39.31 
 
 		 338 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2451  UDP-glucose 4-epimerase  40.62 
 
 		 341 aa  222  6e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0563953  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  40.18 
 
 		 330 aa  222  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  41.69 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  40 
 
 		 337 aa  222  6e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0347  UDP-glucose 4-epimerase  38.66 
 
 		 342 aa  222  7e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0730081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  40.06 
 
 		 327 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  39.41 
 
 		 339 aa  222  9e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  37.54 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  38.92 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  40.59 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  38.24 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  38.96 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  40.3 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  41.1 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  41.67 
 
 		 328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  40.48 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  39.12 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  39.12 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  39.63 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  40.18 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  41.32 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2855  UDP-galactose-4-epimerase  39.24 
 
 		 338 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2943  UDP-galactose-4-epimerase  39.24 
 
 		 338 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  38.02 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  38.66 
 
 		 335 aa  219  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  40.24 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  39.69 
 
 		 329 aa  219  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3334  UDP-glucose 4-epimerase  38.84 
 
 		 342 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.618075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  38.02 
 
 		 328 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  40.41 
 
 		 337 aa  219  7e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  41.41 
 
 		 330 aa  219  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  38.82 
 
 		 340 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  37.42 
 
 		 331 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  40.18 
 
 		 344 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  38.66 
 
 		 335 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  37.5 
 
 		 323 aa  218  7.999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  39.52 
 
 		 339 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  39.24 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  39.12 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1075  UDP-glucose 4-epimerase  38.84 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.320061  normal  0.011198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  37.5 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  38.53 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  37.43 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  38.96 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  41.87 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  40.72 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1413  UDP-galactose-4-epimerase  38.95 
 
 		 338 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>