More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5633 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  100 
 
 		 312 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  75.48 
 
 		 312 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  76.13 
 
 		 312 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  57.51 
 
 		 315 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  40.49 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 322 aa  188  9e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 		 501 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.7 
 
 		 346 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.51 
 
 		 510 aa  182  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.58 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.51 
 
 		 724 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.29 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.22 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 		 349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.26 
 
 		 368 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 459 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 		 350 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 		 340 aa  168  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.39 
 
 		 352 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.76 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  34.08 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  35.51 
 
 		 346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.51 
 
 		 344 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.41 
 
 		 347 aa  160  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.93 
 
 		 348 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.41 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  34.18 
 
 		 326 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 		 336 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.07 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.91 
 
 		 342 aa  149  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.48 
 
 		 342 aa  148  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.11 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  33.99 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.06 
 
 		 342 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  33.88 
 
 		 345 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 		 325 aa  132  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 		 356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  32 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  31.68 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  29.41 
 
 		 352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 		 327 aa  109  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.62 
 
 		 319 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.97 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  29.1 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.87 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  28.99 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  26.97 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.56 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.85 
 
 		 336 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  26.4 
 
 		 316 aa  96.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.21 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  28.3 
 
 		 325 aa  95.9  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 		 359 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  26.47 
 
 		 327 aa  95.9  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 308 aa  95.5  9e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 		 348 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.54 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  26.53 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>