More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2385 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  95.7 
 
 		 350 aa  690    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 349 aa  716    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.48 
 
 		 336 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.13 
 
 		 349 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  61 
 
 		 353 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.65 
 
 		 346 aa  430  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.88 
 
 		 346 aa  430  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.52 
 
 		 353 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  57.18 
 
 		 326 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.37 
 
 		 338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  53.78 
 
 		 347 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.59 
 
 		 342 aa  348  5e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.03 
 
 		 342 aa  343  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.41 
 
 		 350 aa  342  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.41 
 
 		 342 aa  340  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  45.86 
 
 		 342 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.33 
 
 		 340 aa  337  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.22 
 
 		 342 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.82 
 
 		 353 aa  336  5e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.56 
 
 		 347 aa  335  7e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.41 
 
 		 342 aa  334  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.54 
 
 		 352 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  47.8 
 
 		 351 aa  322  7e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.8 
 
 		 351 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.28 
 
 		 351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.13 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.38 
 
 		 501 aa  232  8.000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  40.65 
 
 		 346 aa  226  6e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.45 
 
 		 322 aa  225  7e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.65 
 
 		 344 aa  225  9e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.75 
 
 		 724 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.57 
 
 		 356 aa  212  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.98 
 
 		 459 aa  212  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.31 
 
 		 510 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.77 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  35.84 
 
 		 345 aa  202  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 		 342 aa  199  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.6 
 
 		 342 aa  190  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.94 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.94 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.9 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.75 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  32.76 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  34.94 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.13 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 309 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  31.09 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  30.45 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 		 314 aa  110  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 		 319 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  31.49 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  32.98 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  31.14 
 
 		 328 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1537  UDP-glucose 4-epimerase  31.07 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0024  UDP-glucose 4-epimerase  29.43 
 
 		 332 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  26.49 
 
 		 338 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  27.16 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  26.49 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  27.08 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  26.97 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  32 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  30.48 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  27.08 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  28.82 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  31.64 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  32.23 
 
 		 318 aa  96.7  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  26.67 
 
 		 338 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  31.1 
 
 		 331 aa  95.9  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  26.67 
 
 		 336 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  29.17 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  25.89 
 
 		 338 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  27.42 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  29.17 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  30.83 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  30.13 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  29.17 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  30.36 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  29.17 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2015  UDP-glucose 4-epimerase  32.08 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  28.53 
 
 		 338 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  28.22 
 
 		 338 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  30.48 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  26.71 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  26.71 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  27.86 
 
 		 328 aa  94.4  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>