More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_14431 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  100 
 
 
315 aa  644    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  57.51 
 
 
312 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.32 
 
 
312 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.37 
 
 
312 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  42.15 
 
 
337 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 
346 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 
342 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 
349 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 
338 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 
350 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.26 
 
 
501 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 
349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.46 
 
 
346 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
368 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 
510 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.4 
 
 
322 aa  169  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.57 
 
 
352 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  34.81 
 
 
353 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 
459 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.25 
 
 
724 aa  166  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.44 
 
 
347 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
340 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.7 
 
 
342 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.28 
 
 
342 aa  159  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  37.12 
 
 
326 aa  159  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.81 
 
 
353 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.93 
 
 
350 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 
336 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 
347 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 
353 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.92 
 
 
344 aa  149  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  32.92 
 
 
346 aa  149  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
348 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
351 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.69 
 
 
342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
342 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.93 
 
 
351 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 
342 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  31.17 
 
 
312 aa  139  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
310 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.26 
 
 
342 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  31.17 
 
 
313 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
310 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
310 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.85 
 
 
342 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
312 aa  136  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 
346 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.93 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.41 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
328 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  33.21 
 
 
345 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  31.11 
 
 
352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
319 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  29.2 
 
 
331 aa  105  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 
333 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  33.46 
 
 
314 aa  102  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
315 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
308 aa  100  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
305 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
325 aa  97.4  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 
321 aa  95.9  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  29.64 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  29.64 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  26.01 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 
359 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.32 
 
 
324 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 
312 aa  93.6  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 
327 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 
313 aa  92.4  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
317 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  26.77 
 
 
350 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  29.35 
 
 
329 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
313 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  27.76 
 
 
330 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  23.57 
 
 
320 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.22 
 
 
336 aa  89.4  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
309 aa  89  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  22.71 
 
 
316 aa  89  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  28.87 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
325 aa  87  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
308 aa  87  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.6 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  26.44 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
315 aa  87.4  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
301 aa  87  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  27.31 
 
 
322 aa  87.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 
306 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
309 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
299 aa  86.7  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 
311 aa  86.7  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
348 aa  86.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  24.67 
 
 
328 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  26.56 
 
 
338 aa  86.3  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
308 aa  86.3  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0248885  hitchhiker  0.0015787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>