More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0638 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 
347 aa  691    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.5 
 
 
338 aa  484  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.19 
 
 
342 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.16 
 
 
340 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.78 
 
 
350 aa  371  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.78 
 
 
349 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.16 
 
 
346 aa  359  4e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.21 
 
 
346 aa  352  8e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.06 
 
 
349 aa  351  8.999999999999999e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.06 
 
 
336 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  50.61 
 
 
342 aa  330  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
347 aa  329  4e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  48.53 
 
 
351 aa  328  9e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.08 
 
 
351 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.33 
 
 
342 aa  326  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  50.88 
 
 
353 aa  323  3e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.49 
 
 
342 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.39 
 
 
350 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.18 
 
 
342 aa  322  8e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.29 
 
 
352 aa  317  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.88 
 
 
353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.35 
 
 
351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.61 
 
 
342 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.16 
 
 
353 aa  306  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  48.22 
 
 
326 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.75 
 
 
348 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.16 
 
 
356 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.65 
 
 
501 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.74 
 
 
510 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 
368 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  38.37 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.71 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  35.58 
 
 
346 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.58 
 
 
344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.87 
 
 
459 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.14 
 
 
724 aa  189  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.67 
 
 
342 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  32.75 
 
 
352 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
312 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.42 
 
 
328 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.77 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 
312 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.75 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.83 
 
 
337 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.58 
 
 
330 aa  159  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.49 
 
 
346 aa  145  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
315 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.27 
 
 
310 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.27 
 
 
310 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
312 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  29.26 
 
 
312 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  28.94 
 
 
313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
325 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
310 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
309 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  33.54 
 
 
328 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
321 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
328 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
327 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
317 aa  96.7  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
333 aa  96.3  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  34.22 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
327 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  26.09 
 
 
314 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  30.61 
 
 
331 aa  93.2  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 
329 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.16 
 
 
298 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.89 
 
 
336 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3550  UDP-galactose 4-epimerase  31.42 
 
 
355 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.211522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  34.31 
 
 
318 aa  89.4  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.03 
 
 
336 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  33.98 
 
 
328 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.91 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  27.8 
 
 
319 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  29.88 
 
 
336 aa  86.3  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  33.21 
 
 
321 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  25.98 
 
 
328 aa  86.3  8e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  31.12 
 
 
330 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.43 
 
 
336 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  34.78 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  28.99 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  28.99 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  27.08 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0156  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.02 
 
 
279 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  29.75 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249574  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  31.15 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.77 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16038  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  34.98 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.61 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.36 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>