More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5661 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 329 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.81 
 
 		 334 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.34 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0248885  hitchhiker  0.0015787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  41.43 
 
 		 319 aa  209  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  40.8 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  40.44 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  40.5 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  40.6 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  39.81 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  40 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  40.31 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  41.05 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  42.4 
 
 		 320 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  40.25 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  41.1 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  39.25 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  38.58 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  32.5 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  35.31 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  40.92 
 
 		 327 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  38.64 
 
 		 331 aa  175  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  33.75 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  37.27 
 
 		 327 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  33.44 
 
 		 354 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  40 
 
 		 329 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  38.58 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  34.46 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  35.1 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  38.32 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  36.39 
 
 		 330 aa  169  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  36.72 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  34.69 
 
 		 349 aa  169  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  35.08 
 
 		 324 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  35.29 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  35.19 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  36.39 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  33.64 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  38.98 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  37.04 
 
 		 334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  31.72 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  36.14 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  34.77 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  35.09 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  31.4 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  32.62 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  34.7 
 
 		 329 aa  165  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  32.72 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0893  UDP-glucose 4-epimerase  38.34 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0932116 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  32.21 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  35.2 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  32.2 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  32.32 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  35.98 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  35.37 
 
 		 331 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  36.14 
 
 		 328 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  32.72 
 
 		 328 aa  162  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  35.65 
 
 		 350 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  34.57 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  32.01 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  34.57 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  35.69 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  34.73 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  33.33 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  31.71 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  35.87 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  32.39 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  37.77 
 
 		 351 aa  159  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  34.97 
 
 		 328 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  31.5 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  31.27 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  34.06 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  33.54 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  37.92 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18870  UDP-galactose 4-epimerase  36.53 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  36.65 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  32.21 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  34.23 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  36.45 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  33.44 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  33.43 
 
 		 353 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  31.55 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  33.23 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  35.28 
 
 		 328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  37.32 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  30.46 
 
 		 341 aa  155  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  30.18 
 
 		 339 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  35.47 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  33.93 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  36.65 
 
 		 330 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  29.72 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  34.88 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  33.93 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  31.6 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  31.69 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  33.93 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  32.23 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  33.85 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  32.24 
 
 		 328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  34.57 
 
 		 329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>