More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0857 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 334 aa  660    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.81 
 
 		 329 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.04 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0248885  hitchhiker  0.0015787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  41.88 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  38.77 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  39.01 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  39.33 
 
 		 323 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  38.12 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  40.79 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  35.83 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  38.12 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  38.65 
 
 		 321 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  38.1 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  37.27 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  33.23 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  37.05 
 
 		 329 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  35.8 
 
 		 320 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  33.44 
 
 		 321 aa  170  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  36.11 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  36.25 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  37.08 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  33.33 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  30.98 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  36.83 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  37.31 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  37.89 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  32.92 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  32.54 
 
 		 329 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  37.18 
 
 		 350 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  31.64 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  36.5 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  34.95 
 
 		 327 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  32.62 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  34.66 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  34.35 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  32.63 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  38.6 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  39.04 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  37.74 
 
 		 308 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  32.02 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  34.25 
 
 		 332 aa  159  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  34.97 
 
 		 332 aa  159  9e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  36.86 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  34.86 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  34.36 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  34.13 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  34.98 
 
 		 338 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  33.64 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1392  UDP-glucose 4-epimerase  30.33 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  29.05 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  35.33 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  34.56 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  33.44 
 
 		 331 aa  157  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  34.47 
 
 		 328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  31.17 
 
 		 324 aa  155  7e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  36.64 
 
 		 335 aa  155  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  35.35 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  37.54 
 
 		 327 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  32.72 
 
 		 326 aa  155  8e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  35.28 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  32.75 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  34.35 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  31.83 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  31 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  35.38 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  32.04 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  34.11 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  30.22 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  37.24 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  29.82 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  31.9 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3597  UDP-glucose 4-epimerase  35.69 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  36.59 
 
 		 327 aa  152  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3273  UDP-glucose 4-epimerase  35.69 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.995045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  36.45 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  34.46 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  32.31 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  29.52 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  31.64 
 
 		 333 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  34.36 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  33.44 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  35.8 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  31.74 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  35.82 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  34.36 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  34.53 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  35.89 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  30.72 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  30.72 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  34.94 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  31.09 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  31.74 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  33.54 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  33.23 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  31.8 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  30.42 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  32 
 
 		 324 aa  149  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  32.43 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  33.94 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>