More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23780 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 308 aa  621  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.3 
 
 		 329 aa  175  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.31 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0248885  hitchhiker  0.0015787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 		 334 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  34.48 
 
 		 319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  33.86 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  32.92 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  35.31 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  31.68 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  34.58 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0156  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.71 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  33.64 
 
 		 323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  32.29 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  34.07 
 
 		 320 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  32.81 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  33.13 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  30.94 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  30.94 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  31.33 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  34.27 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  30.5 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  36.45 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  29.94 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  32.4 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  32.81 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 		 329 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  31.53 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14151  UDP-glucose 4-epimerase  27.59 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  30.09 
 
 		 328 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  30.41 
 
 		 337 aa  132  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  31.23 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  31.03 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  34.69 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  32.93 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  31.89 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  32.09 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  33.44 
 
 		 330 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  31.65 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  31.45 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  31.68 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  31.14 
 
 		 337 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3871  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  32.1 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  30.94 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  28.88 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  32.3 
 
 		 332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1836  UDP-glucose 4-epimerase  29.85 
 
 		 337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000102298  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  30.91 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  29.6 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  28.44 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  28.44 
 
 		 330 aa  125  8.000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  33.12 
 
 		 327 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  30.03 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  31.15 
 
 		 332 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  31.15 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  30.6 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  29.28 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  29.69 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  30.46 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  30.22 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  31.87 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  32.44 
 
 		 335 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  32.09 
 
 		 330 aa  122  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  31.15 
 
 		 330 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  28.44 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  30.7 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  30.79 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  29.06 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  30.99 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  30.22 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  31.56 
 
 		 337 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4464  UDP-glucose 4-epimerase  30.06 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  31.65 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  30.51 
 
 		 327 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  31.27 
 
 		 328 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  31.33 
 
 		 333 aa  119  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  29.6 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  31.55 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  28.71 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0893  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0932116 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1119  UDP-glucose 4-epimerase  28.22 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2838  UDP-glucose 4-epimerase  30.82 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  29.75 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  33.23 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  28.75 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14271  UDP-glucose 4-epimerase  27.91 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  29.28 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  30.84 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  30.58 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  31.35 
 
 		 331 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  29.36 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  27.67 
 
 		 330 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  28.75 
 
 		 334 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  32.81 
 
 		 324 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  30.53 
 
 		 328 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  31.5 
 
 		 349 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  29.09 
 
 		 353 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  31.25 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>