More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_14271 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_14271  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 355 aa  721    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12831  UDP-glucose-4-epimerase  51.43 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.225757  normal  0.0431014 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14241  UDP-glucose 4-epimerase  47.56 
 
 		 352 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.353629  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1317  UDP-galactose 4-epimerase  47.88 
 
 		 352 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.218499  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08531  UDP-glucose 4-epimerase  46.53 
 
 		 348 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.264639  hitchhiker  0.00180619 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0221  UDP-galactose 4-epimerase  44.25 
 
 		 347 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.000600389  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25441  UDP-glucose-4-epimerase  40.85 
 
 		 348 aa  305  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  46.4 
 
 		 338 aa  305  6e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  46.84 
 
 		 338 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  43.66 
 
 		 335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  45.69 
 
 		 339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  46.7 
 
 		 336 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2824  UDP-galactose 4-epimerase  45.07 
 
 		 351 aa  299  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 337 aa  299  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 340 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 340 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  44.71 
 
 		 340 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 340 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2068  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 340 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2195  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 340 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  46.13 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0712  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 340 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0994374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  45.98 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  44.7 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  45.69 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  45.69 
 
 		 338 aa  296  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  43.36 
 
 		 338 aa  295  9e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  42.06 
 
 		 340 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  40.92 
 
 		 340 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  45.4 
 
 		 342 aa  292  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  43.53 
 
 		 340 aa  292  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  41.76 
 
 		 340 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  41.47 
 
 		 340 aa  291  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  41.47 
 
 		 340 aa  291  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  43.64 
 
 		 338 aa  291  9e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  41 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  42.77 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  41 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  44.71 
 
 		 336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  43.87 
 
 		 343 aa  289  6e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0774  UDP-galactose 4-epimerase  42.31 
 
 		 336 aa  289  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0405649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  41.18 
 
 		 340 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  40.88 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  44.96 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  43.8 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  40.35 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  40.35 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  41.18 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  44.96 
 
 		 335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  43.52 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  45.59 
 
 		 338 aa  286  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  41.95 
 
 		 373 aa  286  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2339  UDP-galactose 4-epimerase  43.86 
 
 		 349 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569597  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  43.07 
 
 		 334 aa  285  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5595  UDP-galactose 4-epimerase  42.52 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  44.12 
 
 		 337 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  42.4 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  43.82 
 
 		 337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0187  UDP-galactose 4-epimerase  38.97 
 
 		 344 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.611091  decreased coverage  0.00729822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2911  UDP-glucose 4-epimerase  42.86 
 
 		 342 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  43.82 
 
 		 337 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  41.67 
 
 		 341 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0215  UDP-glucose 4-epimerase  40.94 
 
 		 344 aa  282  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  43.99 
 
 		 339 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  41.64 
 
 		 345 aa  282  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  41.67 
 
 		 341 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 		 338 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  42 
 
 		 339 aa  282  7.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 		 338 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  44.12 
 
 		 337 aa  281  9e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  42.65 
 
 		 337 aa  281  9e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76750  UDP glucose-4-epimerase  43.63 
 
 		 688 aa  281  1e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.949645  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  42.65 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2971  UDP-glucose 4-epimerase  45.45 
 
 		 336 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.86287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  43.31 
 
 		 337 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  42.74 
 
 		 337 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  45.16 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  41.09 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  42.12 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  41.79 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  42.12 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  43.24 
 
 		 337 aa  279  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  42.12 
 
 		 337 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  42.94 
 
 		 337 aa  280  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  42.06 
 
 		 340 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  43.34 
 
 		 341 aa  279  5e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  43.11 
 
 		 366 aa  278  7e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  41.83 
 
 		 337 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  41.89 
 
 		 339 aa  278  9e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  41.57 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1892  UDP-galactose 4-epimerase  38.9 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42345  predicted protein  42.52 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.252628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5166  UDP-glucose 4-epimerase  41.33 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.500566 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  40.46 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  41.69 
 
 		 340 aa  276  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  40.92 
 
 		 352 aa  276  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  42.77 
 
 		 338 aa  275  7e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>