More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_12831 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_12831  UDP-glucose-4-epimerase  100 
 
 		 355 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.225757  normal  0.0431014 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14241  UDP-glucose 4-epimerase  53.43 
 
 		 352 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.353629  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25441  UDP-glucose-4-epimerase  55.81 
 
 		 348 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08531  UDP-glucose 4-epimerase  52.29 
 
 		 348 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.264639  hitchhiker  0.00180619 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0221  UDP-galactose 4-epimerase  51.3 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.000600389  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0187  UDP-galactose 4-epimerase  53.14 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.611091  decreased coverage  0.00729822 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14271  UDP-glucose 4-epimerase  51.43 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0215  UDP-glucose 4-epimerase  52.57 
 
 		 344 aa  358  5e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1317  UDP-galactose 4-epimerase  48.55 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.218499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2911  UDP-glucose 4-epimerase  50.57 
 
 		 342 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  48.46 
 
 		 353 aa  338  8e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1892  UDP-galactose 4-epimerase  47.99 
 
 		 377 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  48.71 
 
 		 345 aa  335  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 337 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  47.94 
 
 		 339 aa  333  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  47.99 
 
 		 337 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  48 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  49 
 
 		 343 aa  329  4e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  49.71 
 
 		 337 aa  329  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  48.41 
 
 		 336 aa  329  6e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  48.99 
 
 		 337 aa  328  7e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  47.94 
 
 		 338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  47.55 
 
 		 339 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  47.94 
 
 		 335 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  47.14 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0774  UDP-galactose 4-epimerase  46.61 
 
 		 336 aa  326  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0405649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  48.41 
 
 		 334 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1059  UDP-glucose 4-epimerase  46.97 
 
 		 336 aa  325  6e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0878912 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  48.14 
 
 		 366 aa  325  6e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  47.35 
 
 		 334 aa  323  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  47.7 
 
 		 339 aa  322  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  46.84 
 
 		 335 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  47.85 
 
 		 338 aa  322  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  46.4 
 
 		 337 aa  322  5e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  47.85 
 
 		 340 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  47.85 
 
 		 340 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  47.85 
 
 		 340 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  47.29 
 
 		 340 aa  322  9.000000000000001e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  48.28 
 
 		 338 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  47.99 
 
 		 339 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42345  predicted protein  46.18 
 
 		 352 aa  321  9.999999999999999e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.252628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  48.28 
 
 		 336 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  46.02 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  47.56 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  47.85 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  47.85 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  46.13 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  47.58 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  48.28 
 
 		 337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  46.02 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  46.13 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2195  UDP-glucose 4-epimerase  47.56 
 
 		 340 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2068  UDP-glucose 4-epimerase  47.56 
 
 		 340 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  45.71 
 
 		 336 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 340 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0712  UDP-glucose 4-epimerase  47.56 
 
 		 340 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0994374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  46.44 
 
 		 338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  47.56 
 
 		 340 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  47.13 
 
 		 335 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  47.13 
 
 		 335 aa  319  6e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  45.85 
 
 		 340 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  46.13 
 
 		 340 aa  318  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  45.17 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  48.13 
 
 		 336 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  46.86 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  47.28 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  46.26 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  47.26 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  46.76 
 
 		 336 aa  316  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  45.98 
 
 		 340 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  47.99 
 
 		 339 aa  316  4e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  45.85 
 
 		 340 aa  315  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  47.41 
 
 		 337 aa  315  9e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  46.55 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2339  UDP-galactose 4-epimerase  48.56 
 
 		 349 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569597  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  47.58 
 
 		 339 aa  314  9.999999999999999e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  47.84 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  46.65 
 
 		 351 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  46.44 
 
 		 340 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  47.41 
 
 		 336 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27190  predicted protein  43.53 
 
 		 365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  47.13 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  47.14 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  47.56 
 
 		 338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  48.28 
 
 		 342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  47.56 
 
 		 338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  47.41 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  46.26 
 
 		 340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  47.13 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  47.26 
 
 		 352 aa  313  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 338 aa  312  5.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3663  UDP-glucose 4-epimerase  46.13 
 
 		 336 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000129816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  45.74 
 
 		 373 aa  311  7.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  47.56 
 
 		 338 aa  311  9e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  47.56 
 
 		 338 aa  311  9e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  47.56 
 
 		 338 aa  311  9e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46785  UDP-glucose 4-epimerase  47.01 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  46.13 
 
 		 351 aa  310  2.9999999999999997e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>