More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_14241 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_14241  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 352 aa  708    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.353629  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12831  UDP-glucose-4-epimerase  53.43 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.225757  normal  0.0431014 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0187  UDP-galactose 4-epimerase  46.31 
 
 		 344 aa  359  4e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.611091  decreased coverage  0.00729822 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08531  UDP-glucose 4-epimerase  48.56 
 
 		 348 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.264639  hitchhiker  0.00180619 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1317  UDP-galactose 4-epimerase  52.79 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.218499  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0215  UDP-glucose 4-epimerase  46.31 
 
 		 344 aa  348  1e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0221  UDP-galactose 4-epimerase  48.56 
 
 		 347 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.000600389  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25441  UDP-glucose-4-epimerase  45.98 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14271  UDP-glucose 4-epimerase  47.56 
 
 		 355 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  43.14 
 
 		 345 aa  329  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  47.58 
 
 		 340 aa  327  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  44.15 
 
 		 335 aa  324  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  46.57 
 
 		 336 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  44.13 
 
 		 353 aa  323  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  46.26 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  45.98 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  46.26 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  45.98 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  45.98 
 
 		 336 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  44.19 
 
 		 343 aa  320  3e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  45.56 
 
 		 334 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  45.69 
 
 		 337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 339 aa  319  5e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  42.4 
 
 		 339 aa  319  6e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  43.73 
 
 		 338 aa  318  6e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2824  UDP-galactose 4-epimerase  43.34 
 
 		 351 aa  318  9e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  46.26 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  42.33 
 
 		 341 aa  316  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  44.13 
 
 		 366 aa  317  3e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 		 338 aa  316  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  45.4 
 
 		 338 aa  316  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  42.82 
 
 		 351 aa  316  5e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 		 338 aa  315  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  46.84 
 
 		 335 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  43.84 
 
 		 373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  43.97 
 
 		 340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  45.69 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  46.55 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  44.25 
 
 		 337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  44.54 
 
 		 336 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0774  UDP-galactose 4-epimerase  42.35 
 
 		 336 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0405649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  46.13 
 
 		 337 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  41.76 
 
 		 341 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  41.76 
 
 		 341 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 		 337 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  45.98 
 
 		 337 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  45.87 
 
 		 338 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  43.97 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  41.71 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5547  UDP-glucose 4-epimerase  42.69 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  46.26 
 
 		 337 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  44.99 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  44.54 
 
 		 341 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1601  UDP-glucose 4-epimerase  46.44 
 
 		 337 aa  309  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383307  normal  0.0692735 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2911  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 		 342 aa  309  4e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 		 337 aa  309  5e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  44.03 
 
 		 342 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  44.13 
 
 		 338 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  44.13 
 
 		 338 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  44.13 
 
 		 338 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76750  UDP glucose-4-epimerase  44.94 
 
 		 688 aa  308  8e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.949645  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  45.11 
 
 		 337 aa  308  9e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  44.25 
 
 		 339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  43.84 
 
 		 338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  43.39 
 
 		 340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  42.82 
 
 		 340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  44.25 
 
 		 337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  45.11 
 
 		 337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  44.13 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  44.13 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  45.11 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  42.24 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  45.11 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  43.84 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  43.84 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1059  UDP-glucose 4-epimerase  42.24 
 
 		 336 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0878912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  42.11 
 
 		 334 aa  306  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  43.84 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  44.13 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  44.13 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  44.13 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1892  UDP-galactose 4-epimerase  40.52 
 
 		 377 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  42.33 
 
 		 339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  43.84 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  42.69 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27450  UDP-galactose 4-epimerase  41.78 
 
 		 355 aa  306  5.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  45.69 
 
 		 338 aa  305  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  45.69 
 
 		 338 aa  305  6e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  41.26 
 
 		 338 aa  305  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  44.25 
 
 		 339 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  45.4 
 
 		 337 aa  305  9.000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42345  predicted protein  43.1 
 
 		 352 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.252628  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  45.69 
 
 		 338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  45.69 
 
 		 338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  45.69 
 
 		 338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  41.83 
 
 		 337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  41.95 
 
 		 340 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  41.95 
 
 		 340 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  43.71 
 
 		 341 aa  302  5.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  39.83 
 
 		 338 aa  302  6.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>