More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3193 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
342 aa  708    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.73 
 
 
342 aa  528  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.98 
 
 
342 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.05 
 
 
353 aa  504  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  67.85 
 
 
342 aa  490  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.55 
 
 
347 aa  483  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.41 
 
 
350 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.41 
 
 
342 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.76 
 
 
352 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.24 
 
 
351 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  52.94 
 
 
351 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.53 
 
 
351 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.44 
 
 
346 aa  345  8.999999999999999e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.41 
 
 
350 aa  342  5.999999999999999e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.22 
 
 
349 aa  336  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.16 
 
 
336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.45 
 
 
349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.82 
 
 
342 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 
346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.69 
 
 
338 aa  305  6e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  46.02 
 
 
353 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  50.61 
 
 
347 aa  298  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.02 
 
 
353 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.09 
 
 
340 aa  295  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  42.31 
 
 
326 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.63 
 
 
344 aa  215  8e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  35.63 
 
 
346 aa  215  8e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 
348 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.14 
 
 
368 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 
322 aa  202  6e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.18 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  36.21 
 
 
345 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.61 
 
 
724 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.46 
 
 
459 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.41 
 
 
342 aa  186  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
501 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.12 
 
 
510 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 
342 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  32.29 
 
 
352 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.83 
 
 
328 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.8 
 
 
312 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.31 
 
 
312 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  36.07 
 
 
312 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 
330 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
346 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.33 
 
 
315 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
325 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.73 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
325 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
310 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
310 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
319 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
310 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
309 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  27.27 
 
 
314 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 
321 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  27.39 
 
 
313 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  26.75 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
314 aa  92.8  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  31.41 
 
 
329 aa  90.9  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  32.48 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  30.74 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  29.93 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  30.37 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  30 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3550  UDP-galactose 4-epimerase  28.78 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.211522 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  29.33 
 
 
328 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
327 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  28.36 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  29.32 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.74 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  27.34 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  27.94 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  27.94 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  28.26 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2285  UDP-glucose 4-epimerase  27.57 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  26.74 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  29.97 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  28.73 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  30.63 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.09 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  29.82 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  29.29 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1392  UDP-glucose 4-epimerase  28.42 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3663  UDP-glucose 4-epimerase  25.37 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000129816  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  29.06 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1537  UDP-glucose 4-epimerase  28.76 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  28.99 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>